楼主 | 收藏 | 举报 2018-03-15 10:09   浏览:481   回复:4

用慢病毒或siRNA转染细胞后,PCR和WB的结果不一致,怎么筛选干扰效率最高的siRNA呢?

用慢病毒或siRNA转染细胞后,通过PCR和WB检测,筛选出干扰效率最高的siRNA,但是如果PCR和WB的结果不一致该怎么办呢,以哪个结果为参考呢?
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沙发 | 回复 | 举报 2018-03-15 23:33

Please show the RT-qPCR and WB results.

藤椅 | 回复 | 举报 2018-03-16 06:40

验证慢病毒干扰效率时,比如用第一个干扰慢病毒处理细胞后,在PCR结果显示干扰效率为70%,但是WB结果却没有明显差异;用另一个干扰慢病毒处理细胞后,PCR结果显示干扰效率<50%甚至更低,但WB结果显示目的蛋白表达有差异。那么最终选择哪个慢病毒做正式实验呢?

板凳 | 回复 | 举报 2018-03-16 14:03

You can not try to compare levels of mRNA vis levels of the mRNA translated products. By target mRNA kncokdown you need to determine whether the translation of the tearget mRNA is affected or not. If it is not, 25% -50% of remained mRNA would make enough amounts of its protein products.


马扎 | 回复 | 举报 2018-03-16 14:09
WFy1991
用慢病毒或siRNA转染细胞后,通过PCR和WB检测,筛选出干扰效率最高的siRNA,但是如果PCR和WB的结果不一致该怎么办呢,以哪个结果为参考呢?

蛋白为先

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