楼主 | 收藏 | 举报 2012-06-14 21:21   浏览:306   回复:22

【求助】PCR产物切胶回收后浓度总是非常低,都要疯了。

小弟最近在做PGL3的重组质粒,想要把OBR的启动子连接到PGL3上,通过PCR技术我得到很好的目的条带,亮度好,特异性也好,但是每次切胶回收都浓度非常低,只有十几ng/ul。甚至四管PCR产物和在一起回收也是这么低,急死了。别人一管PCR回收都能到50ng/ul.我的总是收不到,试剂盒没有问题,别人用的很好啊,操作也没问题,别人替我回收过,也是没有回收回来,浓度也是十几ng/ul.现在要疯了,PCR产物得不到就没办法酶切,更别谈连接转化了。求求给位了,求求给位,这事怎么回事????????????感激不尽啊,感激不尽。
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沙发 | 回复 | 举报 2012-06-18 20:40
1、如果试剂盒没问题的话,考虑一下片段大小。如果太小的话(500bp或以下), 加入结合液后,向其中再加入1/3体积的异丙醇,然后按操作说明书操作。
2、溶胶一定要非常仔细,并且彻底!
3、溶胶以后,注意体系的pH值,如果pH值太高,也会影响回收。
藤椅 | 回复 | 举报 2012-06-14 23:42
如果你急着做,多做几个pcr分别回收,加起来就够了。
你跑过胶吗,你的产物看起来如何?
板凳 | 回复 | 举报 2012-06-15 10:13
跑过胶,条带正确,但是亮度不高,也就是说浓度不高。我PCR过四管,也不行。
马扎 | 回复 | 举报 2012-06-15 12:13
Try to run low melting temperature agarose gel and extract the PCR fragments from the gel with ddH2O saturated phenol only, and clean the DNA with phenol/chloroform, and ethanol precipitation in the presence of glycogen.
地板 | 回复 | 举报 2012-06-17 14:42
PCR结束了,试试直接做酶切呗,再跑电泳,做胶回收,回收的片段只要有(<10ng/ul都没关系),就可以做连接的。
or 过一个中间载体。
6楼 | 回复 | 举报 2012-06-17 15:52
大量的做切胶回收,回收后,用乙醇沉淀,浓缩一下
7楼 | 回复 | 举报 2012-06-18 11:01
特异性较好,可直接用PCR清洁试剂盒纯化下直接酶切,不需要再做胶回收了。AXYGEN爱思进PCR清洁试剂盒可以做到。
8楼 | 回复 | 举报 2012-06-18 12:23
十几ng/ul可以接着做,没问题,你至少有30ul吧,那就四五百ng,酶切产物回收一次就算再损失一半也够的,我最低连接试过1ng/ul,可以连上的,不用疯 =D
9楼 | 回复 | 举报 2012-06-18 14:46
zhanggo
小弟最近在做PGL3的重组质粒,想要把OBR的启动子连接到PGL3上,通过PCR技术我得到很好的目的条带,亮度好,特异性也好,但是每次切胶回收都浓度非常低,只有十几ng/ul。甚至四管PCR产物和在一起回收也是这么低,急死了。别人一管PCR回收都能到50ng/ul.我的总是收不到,试剂盒没有问题,别人用的很好啊,操作也没问题,别人替我回收过,也是没有回收回来,浓度也是十几ng/ul.现在要疯了,PCR产物得不到就没办法酶切,更别谈连接转化了。求求给位了,求求给位,这事怎么回事????????????感激不尽啊,感激不尽。
我平时做回收时
有时即使浓度是低到快0了
拿来直接做T4连接 也是可以的
lz10几ng了 这个浓度 绝对是可以做连接的呀

你只是需要最后得到连接产物
不需要纯化得多完美 浓度多高
没有意义
你想想0.0001ng/uL 2ul里就有0.0002ng 片段
折算成mol量 和片段数
也是可以做连接的
10楼 | 回复 | 举报 2012-06-18 20:40
1、如果试剂盒没问题的话,考虑一下片段大小。如果太小的话(500bp或以下), 加入结合液后,向其中再加入1/3体积的异丙醇,然后按操作说明书操作。
2、溶胶一定要非常仔细,并且彻底!
3、溶胶以后,注意体系的pH值,如果pH值太高,也会影响回收。
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