7月21日,发表在Science上的一项研究中,科学家们发表了关于染色体追踪的一项重要成果。哈佛大学庄小威教授以及哈佛医学院Chao-ting Wu 教授是本文的共同通讯作者。
染色质的空间组织从很大程度上影响着基因组的功能。最近,科学家们通过染色体-构象-捕捉揭示了间期染色体大量的结构信息,如拓扑关联域(topologically associating domains, TADs)。然而,TADs在单条染色体中的空间组织是怎样的目前仍不清楚。
荧光原位杂交(FISH)技术为直接成像染色体的空间组织提供了强有力的手段。尽管如此,由于对间期染色体上的许多基因组区域进行同时成像,并达到清楚识别存在困难,研究染色体复杂的3D折叠途径依然有很多挑战。
在这一研究中,科学家报告了一种新的FISH方法,可用于绘制单条染色体中多个基因组区域的空间位置,以及研究人类常染色体和X染色体TADs的空间安排等。研究结果表明,染色质域(chromatin domains)的空间组织能够响应调控发生变化。
2016年已发表10篇研究论文
庄小威是著名的华裔女科学家,早年毕业于中国科技大学少年班,34岁时成为了哈佛大学的化学和物理双学科正教授。2012年, 庄小威当选为美国国家科学院院士,刷新了美国科学院最年轻华人院士的纪录。2015年,庄小威当选中国科学院外籍院士。
今年来,庄小威教授带领的研究小组已经Nature、Science、Cell发表了多项研究成果。以下庄教授实验室官网列举的2016年发表的论文:
1.Nature(1月13日)
Super-resolution imaging reveals distinct chromatin folding for different epigenetic states
2.Nature Communications(1月13日)
Chromatin topology is coupled to Polycomb group protein subnuclear organization
3.Science(2月12日)
Spatial colocalization and functional link of purinosomes with mitochondria
4. eLife(2月19日)
Stepwise nucleosome translocation by RSC remodeling complexes
5. Methods in Enzymology(4月27日)
RNA Imaging with Multiplexed Error-Robust Fluorescence In Situ Hybridization (MERFISH).
6. Cell(5月5日)
Real-Time Imaging of Translation on Single mRNA Transcripts in Live Cells
7.PNAS(5月9日)
Prevalent presence of periodic actin-spectrin-based membrane skeleton in a broad range of neuronal cell types and animal species
8. eLife(5月20日)
Spatial organization shapes the turnover of a bacterial transcriptome
9.Scientific Reports(5月27日)
An RNA-aptamer-based two-color CRISPR labeling system
10. Science(7月21日)
Spatial organization of chromatin domains and compartments in single chromosomes