求助：细胞核质分离RNA亚细胞分布怎么算？

这种文献结果怎么算的？小弟是一名本科生在写毕业论文，不才。求大哥大姐们指点一下。

我做的是原代肝细胞核质分离，目的基因两个，内参基因用的是GAPDH和U6。

我设计的qPCR

引物1-细胞质

引物1-细胞核

引物2-细胞质

引物2-细胞核

内参1-细胞质

内参1-细胞核

内参2-细胞质

内参2-细胞核

目前只能算出一个图标数据。。。上面论文的怎么算出来的？GAPDH U6在核质的比例。。

 

真心求解啊，各位师兄师姐

楼主 你好 我也看到这个文章里的这个试验了 也正在做。我是这样理解的，不知道正确与否。

文章里面比较的是百分比，而不是绝对值。也就是说 根据你的目的基因的CT值就可以画出文章中的条形图。

假设你的目的基因在细胞质中表达和细胞核中表达的CT值分别为3和7，那么根据百分比，目的基因在细胞核中的表达就可以认为是30%（用3除以3+7），同理，在细胞质中的表达就占到70%。根据上述比较方法，就可得出如文章中的条形图。

我是这样理解的 不知道对不对。

还有一个问题，楼主，可否把你的U6和GAPDH的引物序列告诉我，我用的是师兄们以前的引物，但是效果不是很好。U6和GAPDH在细胞质、细胞核中的表达我做出来的结果并没有你做出来的结果差异那么明显。

谢谢！

楼主实验怎么样了，可以分享一下引物序列吗，谢谢谢谢谢啦

究竟怎么算的啊，求解

同求U6和GAPDH 的序列，我们现在的U6做出来细胞质，细胞核里都有，另外请问逆转录的引物是从哪里合成的？和qPCR应该不是一个引物吧？

你好 请问这个你计算出来了吗？我想向你请教下。谢谢！

请问楼主问题解决了吗？到底是怎么计算分析呢？

搞清楚了么？