“就提取几个序列,不需要命令行”
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刚接触生物信息学的同学,或者(和我一样)只是使用生物信息相关知识来服务伟大种树事业的同学,
有时候需要“根据一个基因id列表,批量提取fasta记录”
这里提供一个jar包,
下载链接(360网盘):
http://yunpan.cn/csbp7j7fmhkAZ 访问密码 6b43
具体界面如下:
使用说明:
1.点击A Fasta files ,选择待提取的fasta文件 2.点击An ID List,选择id 列表文件,(每行1个id) 3.点击Set Output Directory,设定输出文件目录 4.点击Get Result ! 5.根据弹窗信息,在第3.步中设定的输出文件目录下可以找到结果文件 |
FAQ:
-1. 请先安装java….jvm…一般都是已安装的
0. 关于非命令行版,也写了,只是不如直接用perl命令行,见《生物信息初学者常用perl-oneliner》
1. Must 设定输出文件目录…java基础还有限,等书到了,学习完了再优化
2. 任何其他问题,请留言
原文地址:一个生物信息初学者的blog http://www.pineapplechina.com/?p=142