wapRNA是一个RNA序列数据处理的网络平台,支持RNA和microRNA两种序列分析。它集成了多种分析工具,为处理下一代测序技术平台,如(Solexa,SOLiD)产出的RNA序列数据提供了便利。通过计算分析,wapRNA可以为研究者提供多种序列信息,如:基因表达量,基因水平突变,基因功能;在microRNA方面,注释已知的microRNA,预测新的microRNA,预测靶基因等。
wapRNA的特点:
- 基于web,操作简单。
- 支持两种测序数据:SOLiD和Solexa。
- 短序列比对,并且提供比对结果。
- 基于ENSEMBLE,TIGR,BROAD等的序列注释。
- 基于序列比对和文本注释进行数据挖掘。
- 流程集成了常用的功能分析工具(GO,KEGG)。
服务器网址:http://waprna.big.ac.cn/
相关软件下载链接:http://waprna.big.ac.cn/rnaseq/download/download.jsp
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