「工欲善其事,必先利其器」,对于从事生物信息学研究,软件和工具绝对是必不可少的。您对生物信息学常用的软件和工具可能进行过简单的了解和使用,但您可能在使用的过程中会遇到各种各样的疑问,如面对众多的生物信息学分析软件却不知该如何选择应用?对于软件繁杂的使用方法和众多参数不知如何取舍?为了解决您遇到的困扰,打开您的思绪,北京市计算中心生物计算事业部举办《生物信息学软件与工具使用培训班》。
介绍生物信息学研究及数据分析中所用的各种数据库使用,通过实际项目演练,学习常用分析软件的使用方法,将课程各项知识点融会贯通,从而使学员深刻理解并掌握生物信息学数据库和工具使用的要点。大家赶快一起来交流探讨吧!一流的学员和经验丰富的老师在这里等着你的到来!
授课对象: 全国生命科学、基础医学、农林科学等领域大专院校、科研机构、公司企业从事分子生物学、生物化学、遗传学、基因组学等研究、开发和教学的第一线研发人员和青年教师、博士后和研究生。
主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:北京市计算中心
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
北京微生太科技有限公司
北京依托华茂生物科技有限公司
培训地点:北京海淀区丰贤中路 7 号 3 号楼,北京市计算中心三层会议室
本次课程时间: 2018.4.16-19 上午:9:30 - 12:00 下午:1:30 – 5:00
日期 |
时间 |
课程名称 |
课程内容 |
第一天 上午 |
09:30- 10:30 |
生物信息学概述与前沿 |
1. 基因组学与生物信息学背景知识介绍 2. 生物信息进展与前沿技术介绍 |
10:30-12:00 |
CBI 数据库 |
CBI 数据库介绍:PubMed、Nucleotide(GenBank)、Genome、Structures(MMDB)、Taxonomy、UniGene、Entrez 等,数据查询检索 |
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第一天 下午 |
13:30-15:00 |
CBI 数据库 |
2. NCBI 数据库数据上传提交与批量下载 3. NCBI 数据库实例讲解与练习 |
15:00-17:00 |
last 与序列比对 |
1. Blast 与序列检索比对及参数 2. Blast 建库与 Blast 本地化 3. 实例讲解与练习 |
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第二天 上午 |
09:30-12:00 |
MEGA 软件与分子进化 |
1. 分子进化理论基础 2. MEGA 与系统发育树构建 3. 实例讲解与练习 |
第二天 下午 |
13:30-17:00 |
分子网络与生物学通路分析 |
1. 分子相互作用数据库与通路概述(Uniprot,String,DIP 数据库) 2. 分子网络分析工具 Cytoscape 及插件使用 3. 实例讲解与练习 |
第三天 上午 |
09:30-12:00 |
基因组注释 |
1. 基因本体数据库 GO 及 GO 注释 2. 生物学通路 KEGG 注释方法与实现 3. David 与基因注释 4. IPA 简介,查询搜索,通路分析与网络构建 |
第三天 下午 |
13:30-15:30 |
疾病和基因突变数据库 |
1. GeneCard 数据库介绍及使用 2. HGMD(人类基因突变数据库)数据库介绍及使用 |
15:30-17:00 |
药物基因组数据库 |
1. PharmGKB 数据库介绍及使用 2. PGMD 数据库介绍及使用 |
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第四天 上午 |
09:30-12:00 |
表观遗传学 |
1. Encode 数据库介绍及使用 2. Roadmap 数据库介绍及使用 3. RegulomeDB 数据库介绍及使用 |
第四天 下午 |
13:30-15:30 |
蛋白质 3D 结构 |
1. 蛋白质结构分析概述 2. PDB 数据库介绍与使用 3. PyMol 蛋白质结构分析软件介绍与使用 |
15:30-17:00 |
软件与生物统计应用 |
1. 生物统计概述 2. SPSS 使用与生物统计应用 3. 实例讲解与练习 |
(课程内容以实际授课为准)
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
【报名费用】培训费 4000 元/人,含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑用以上机实习。材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社;近最近酒店为:如家酒店(永丰店),可自行网上预定,食宿自理。【报名优惠政策】
1、3.20 日前报名并缴费可优惠 200 元;
2、3 人以上团体报名每人可减少 300 元;
3、4+1 团报,可免费赠送一个名额;
以上优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
以收到学员培训费为成功报名,座位按收到费用先后顺序安排。
【付费方式】现金、支票、银行转账、银行汇款、现场刷卡
单位全称:北京市计算中心 账 号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(备注:在汇款明细里加上「生物计算事业部——您的姓名+单位」)
【联系咨询】
QQ 号:3498448850
张老师 18618295767, 邮箱:18618295767@163.com
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