收藏  |   举报 2009-04-10 22:17   关注:239   回答:37

【公告】2009形态版第一场实验技术讲座: 组化、WB、PC...

已解决 悬赏分:0 - 解决时间 2024-12-27 09:30
【公告】2009形态版第一场实验技术讲座: 组化、WB、PCR、细胞计数等图像分析原理及其问题答疑活动(已经结束)[精华]
举报 2009-04-11 03:25
image J 与scion image也是常用的图像分析软件。它俩都是免费的,所以经常使用。功能略差于IPP,但通常的分析工作也能作。所以在许多论文里都用它们来分析测量图象。免疫组化图象也能作的。
举报 2009-04-15 19:02

展开引用

zhenglb1982
请教wh2008战友
我做前列腺的研究,有文献报道用IPP分析,得出percent area density。请教,这个 percent area density是面积比例吗?

原文如下:
For stereological analysis, we used Image-Pro Plus 5.0 software (Media Cybernetics, Inc,Maryland, USA). The histological composition of prostatic ventral lobes was investigated according to Delese’s principle [15]. The examination, description and scoring of the slides was conducted while unaware of sample origin.【 BJU Int, 2007, 100(5): 1161-1165】

......


分析过程可能是这样的:
以前分析软件时只用单色图片,通过选择灰度阈值来测量图片上灰度大于某个值的所有象素点的测量数值。例如这张图片上,把灰度阈值定在174,比这个值黑的地方基本就是组织区域。用histogram工具就能测量到它们的象素数量(反映了面积)为250556.点整张图片的60.7%。这里percent area density大概是“灰度小于阈值部分的面积比例”

现在用IPP的count/size工具测量灰度图片时,先通过segmentation选择阈值为0-174.然后计算面积,在statistics窗口中可以得到area SUM为250556.

测量原理基本上相同,但测量思路却大不一样了。这是分析技术的进步。现在的方法更加直观易理解。
举报 2009-04-18 22:40
smile9911023
现在最关注的还是ipp对RT-PCR的电泳结果分析步骤。

问题如下:
1、表达量选用什么合适?
2、如何分析电泳结果?
3、详细步骤?

这个用IPP作确实不合适。得用gelpro之类软件来作。
举报 2009-04-13 08:57
如果需要ipp软件下载的战友可以到veryCD上去下载《专业图像分析软件》(Image-Pro Plus)6,让我们一起学习,共同进步!
举报 2009-04-10 23:48
提问举例:

一、免疫组化定量分析

1、首选哪种图像定量分析方法?

2、用IPP分析酶免疫组化的优势和不足在哪里?

..................................................

二、Western blotting定量分析

1、用IPP分析WB结果,是用灰度还是光密度分析?

2、用IPP分析WB结果的必要条件是什么?

3、相比较其他图像定量分析方法,用IPP分析WB的优势和不足是什么?

...........................................................

三、免疫荧光定量分析

...........................................................

四、细胞计数

...........................................................

五、RT-PCR电泳图片分析

...........................................................

欢迎你的提问,我们一定会给你满意的答复!!!!
举报 2009-04-19 14:23
太好的活动了
正是我这个新人需要的
万分感谢
举报 2009-04-22 00:38
近10天内有关图像分析的求助链接汇总;

1、【求助】为什么ipp用irregulation时不能add多个AOI?

2、【求助】请问ipp是否可以测量普通照片的光密度?和圈定测量区域范围

3、【求助】免疫组化结果分析问题

4、【求助】ipp软件的保护锁?

5、【求助】IPP分析

6、【求助】IPP软件在哪里能免费下载

7、【求助】IPP怎样定量分析量子点荧光图片?急呀!

8、【求助】image J里用什么filter去除图中杂质点

9、【求助】求IPP分析软件

10、【求助】Image-Pro Plus 6.0 时,切片太大,需拍多张照片,如何计算面积呢?

11、[url=]不断更新中............[/url]
举报 2009-04-11 14:47
好像论坛有个关于IPP使用的详细教程,但是对于大多数人来说学起来还是比较费劲,这里wh2008战友重启这项工程,为更多的战友提供帮助值得称赞。
预祝活动圆满成功!!!

欢迎lencho83版主前来指导--wanliheng
举报 2009-04-16 07:51
欢迎各位战友前来参与讨论和交流,预祝此次活动圆满成功。
举报 2009-04-11 04:33
欢迎各位战友前来学习!大力支持!
 «上一页   1   2   …   3   4   下一页»   共37条/4页 
网站首页 | 关于我们 | 联系方式 | 使用协议 | 版权隐私 | 网站地图  |  排名推广  |  广告服务  |  积分换礼  |  网站留言  |  RSS订阅  |  违规举报
 
免责声明:本站有部分内容来自互联网,如无意中侵犯了某个媒体 、公司 、企业或个人等的知识产权,请来电或致函告之,本网站将在规定时间内给予删除等相关处理。