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2017-04-25 03:14
首先,基因突变的原因非常多,从实验操作和可控因素的角度来讲,可以考虑基因扩增是否利用高保真酶。 其次,该基因具有理论碱基序列就可以利用软件来进行翻译成蛋白,比如利用clone manager8软件(网上有免费软件包)等,通过它的功能可以将基因翻译成蛋白。通过ORF的通读就可以找到目的基因翻译出来的蛋白。假如276位碱基突变(3个密码子翻译一个氨基酸),说明由ata突变成atg,即氨基酸由异亮氨酸突变成甲硫氨酸,氨基酸发生了突变。当然有碱基突变然而氨基酸不突变的情况,你的样品不属于这种情况。 最后,测序结果和你的基因理论序列进行多序列比对,可以利用NCBI-Blast在线数据库比对,也可通过clone manager8进行多序列比对,通过这种方式可以看出你的基因突变是否为新的突变。 祝好运 |
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2017-04-27 16:12
ponktong ...... 请仔细看你的峰图,其中第269位,有一个杂合双峰,是C/T的杂合峰。然后把这段序列进行BLAT 好像参考序列是反的。这个基因是CASR基因,突变绝对位置是chr3:g.121980541G>A (反向序列是C>T) 用cds编号似乎是c.659G>A, sift评估0.23, polyphen评分1. dbsnp数据库以及千人数据库显示,这个位点无记录,也就是新突变。具体突变为: CASR:NM_000388:exon4:c.G659A:p.R220Q |
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2017-05-02 09:04
wobuxin ...... 帮我看看好吗 |