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【求助】过表达不升反降,干扰不降反升...

已解决 悬赏分:0 - 解决时间 2024-12-03 07:21
【求助】过表达不升反降,干扰不降反升
举报 2015-03-18 20:42
我也是在做这个诶。用G418筛选出来的几个混合细胞株,仅仅是有些会有过表达。
你可以试试挑选单克隆。
举报 2015-03-24 02:55
谢谢你
我之前过表达就是挑单克隆鉴定的,挑了可能有三四十个都没有,师兄说不会有做不出来的过表达,我就是想不明白可能的原因
举报 2015-03-13 20:33
ccyyatt521
谢谢你
我之前过表达就是挑单克隆鉴定的,挑了可能有三四十个都没有,师兄说不会有做不出来的过表达,我就是想不明白可能的原因

太可怕了挑了三四十也这样。。 我是做到扩增单克隆这一步。还没到最后跑western检测呢。
前几天将几个pool 跑了胶,7个pool只有3个是抬高的。今天不放心又做了3个96孔板。
你选的这个细胞应该本来表达也不低吧?所以过表达也不明显。如果瞬时转染甚至加G418筛选之后没有抬高,说明阳性细胞很少很少,这里面有个概率问题,比如说1百个里面只有1个,再加上运气不佳,挑了三四十个克隆没有一个阳性是有可能的。
个人感觉。。。质粒序列包括抗性序列和你的目的蛋白序列。转进基因组,有几种可能,一个是两个片段都转进去了两个都开始表达,这是我们想要的阳性细胞;一个是只有抗性序列转进去了抗性序列在表达目的蛋白没有表达,或者说即使目的蛋白转进去了但是它就是不表达(因为对细胞生存不是需要的),这是假阳性,所以才需要挑选。蛮讲运气的感觉。
就是说都是假阳性啊。。。
举报 2015-03-15 17:16
之前我师姐说挑了三四十个挑出来7个。。我感觉我有一个就已经很开心了。。。
举报 2015-03-20 21:49
还有要考虑western内参齐不齐。怀疑你上样量不一致。
举报 2015-03-22 03:51

展开引用

ccyyatt521
大家好,最近做实验遇到了很棘手的问题:
克隆一个基因,构建好过表达质粒载体,稳定转染细胞,g418筛选稳定克隆,让其在细胞系中过表达,但western blot显示大部分克隆基因的表达量下降,没有挑出稳定过表达的克隆;
接着做shrna干扰,交给公司合成了四种shrna质粒,也是打算进行稳定转染,g418筛选,但先做了个瞬时转染预实验,转染换液后48小时收蛋白,western blot鉴定,发现实验组都比对照高。
请问,有没有大神遇到过这种情况,如果有,可能的原因是什么,有没有解决的方法,有没有相关的文献支持?
谢谢,不胜感激!

......


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