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crispr/cas9 实验设计...

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crispr/cas9 实验设计
举报 2017-05-04 20:39

那么后续你选择性的做个分选rfp 阳性细胞。可以先做个wb检测蛋白的表达有没有下去.然后再根据你的测序结果判断的移码突变的比例,分单细胞到96 孔板,然后扩大培养,比如,你的移码突变做出来是40%。那么十个扩大培养里面就有四株是ko的。可以再做wb检测。

举报 2017-04-29 10:19

先设计sgRNA,买Crispr质粒,把sgRNA克隆到质粒里,然后转染细胞,然后进行PCR,看有没有敲除。

举报 2017-04-29 08:01
kangaroo0513

先设计sgRNA,买Crispr质粒,把sgRNA克隆到质粒里,然后转染细胞,然后进行PCR,看有没有敲除。


细胞层面呢?检测蛋白?
举报 2017-05-05 09:54
小白同学,你先去看看一篇综述,然后把你的想法计划贴出来。然后再让我们提意见比较好。
举报 2017-04-29 06:59
在线设计sgRNA,构建质粒(sgRNA cDNA+cas9+mcherry),脂质体转导,检测荧光信号以证明质粒的进入情况,PCR扩增目的区段,测序。 这是分子层面,想要到细胞层面就不知道怎么办了
举报 2017-05-01 00:26

那么后续你选择性的做个分选rfp 阳性细胞。可以先做个wb检测蛋白的表达有没有下去.然后再根据你的测序结果判断的移码突变的比例,分单细胞到96 孔板,然后扩大培养,比如,你的移码突变做出来是40%。那么十个扩大培养里面就有四株是ko的。可以再做wb检测。

举报 2017-05-01 23:28

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sicaujj

那么后续你选择性的做个分选rfp 阳性细胞。可以先做个wb检测蛋白的表达有没有下去.然后再根据你的测序结果判断的移码突变的比例,分单细胞到96 孔板,然后扩大培养,比如,你的移码突变做出来是40%。那么十个扩大培养里面就有四株是ko的。可以再做wb检测。

......


然后就有个小问题,如果突变点太小,不影响蛋白表达,或者说WB检测不出,会不会存在这样的可能?
举报 2017-05-02 11:57
柳清扬

然后就有个小问题,如果突变点太小,不影响蛋白表达,或者说WB检测不出,会不会存在这样的可能?

所以你该focus在移码突变上。一般来说sgRNA都是target the first exon.
举报 2017-05-05 20:02
怎么是focus在移码突变?不太懂,我的感觉就是有蛋白,分选就有信号,WB就有条带,是不是?但是分选没信号就一定是crispr有作用吗?而且这样是在验证其切割效率,只要有切割就能证明它work了吗?
举报 2017-05-03 10:07
柳清扬
怎么是focus在移码突变?不太懂,我的感觉就是有蛋白,分选就有信号,WB就有条带,是不是?但是分选没信号就一定是crispr有作用吗?而且这样是在验证其切割效率,只要有切割就能证明它work了吗?

移码突变才是要的结果,这样子才算ko。你的第二句话逻辑我不是很懂。
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