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荧光定量PCR,模板浓度够高,CT仍30多,原因何在...

已解决 悬赏分:0 - 解决时间 2024-11-12 08:55
荧光定量PCR,模板浓度够高,CT仍30多,原因何在
举报 2017-05-03 18:16
tm值是否为单峰,调整为低浓度,或者倍比稀释看看,浓度大有时候并不是好事
举报 2017-05-06 02:22
你的cDNA浓度是怎么测出来的?一般测的不是RNA浓度嘛?cDNA因为反转的加入了很多dNTP所以不准的
举报 2017-05-04 16:26
什么没看
tm值是否为单峰,调整为低浓度,或者倍比稀释看看,浓度大有时候并不是好事

是单峰的,稀释了10后,内参的CT值又大了

举报 2017-05-07 08:15
chixinzero
你的cDNA浓度是怎么测出来的?一般测的不是RNA浓度嘛?cDNA因为反转的加入了很多dNTP所以不准的

我是反转录后测的cDNA浓度。是从六孔板一空的细胞用trizol 提的RNA,是细胞太少了吗?有一次也测过RNA,浓度有700 ng/ml左右,但没做PCR。
举报 2017-05-08 04:08
Mis願

我是反转录后测的cDNA浓度。是从六孔板一空的细胞用trizol 提的RNA,是细胞太少了吗?有一次也测过RNA,浓度有700 ng/ml左右,但没做PCR。

你在反转的时候,其实加入的很多的dNTP,但是测浓度的原理,也是测碱基的含量,所以你测cDNA的浓度肯定不对的,还有就是一般我们反转都会测完RNA浓度后统一配平到一个浓度,以此来确定cDNA浓度
举报 2017-04-27 04:07
chixinzero

你在反转的时候,其实加入的很多的dNTP,但是测浓度的原理,也是测碱基的含量,所以你测cDNA的浓度肯定不对的,还有就是一般我们反转都会测完RNA浓度后统一配平到一个浓度,以此来确定cDNA浓度

配平具体怎么做,怎么来确定cDNA的浓度。对咯,我是做相对定量的,这个有关系吗?

举报 2017-04-27 07:36
其实没关系的,每个反转试剂都有具体的说明的吧,我用过两个都说让配成统一浓度的
举报 2017-05-07 14:57
Mis願
real time RT-PCR,测了模板cDNA浓度1800ng/ml,纯度在1.96左右,但是检测内参GAPDH,CT值都有30多,目的基因的CT更大了。请问问题在哪里,CT值大不就是因为模板量不够吗,可是现在这个浓度显然是充足的,怎么解释?

给你个建议,换个试剂盒试一下。如果RNA跑胶没问题的话。
举报 2017-05-04 15:11
Mis願
real time RT-PCR,测了模板cDNA浓度1800ng/ml,纯度在1.96左右,但是检测内参GAPDH,CT值都有30多,目的基因的CT更大了。请问问题在哪里,CT值大不就是因为模板量不够吗,可是现在这个浓度显然是充足的,怎么解释?

学习
举报 2017-04-28 06:27

溶解曲线单峰,那么温度值是多少?如果低于80很有可能都是引物二聚体,有没有阴性对照?看阴性对照的值和样品值是否相近。内参都那么大的值,很怀疑模板有问题,或者引物有问题啊,你可以先跑个普通pcr试试,看看能否跑出单一目的条带

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