提供商: | 上海吐露港生物科技有限公司 |
服务名称: | 细菌基因组测序 |
规格: | 细菌基因组(<5M) |
细菌基因组测序
服务简介
随着新一代测序技术的迅猛发展,全基因组测序已经成为细菌基因组研究不可或缺的重要工具。下一代高通量测序技术大大降低了细菌基因组研究的成本,缩短了研究周期,为越来越多的实验室提供了细菌基因组研究的便利。吐露港生物科技采用PacBio平台结合Illumina测序平台,可以提供高效、快速、廉价的细菌基因组完成图。
服务类型
根据不同的研究目的和需求,吐露港提供以下3类服务供选择:
(1)细菌精细图:采用大片段加小片段建库,然后利用Illumina HiSeq2500深度测序和初步的基因组组装策略,性价比高,满足细菌基因组研究基本需求。
(2)细菌完成图:综合利用PacBio RSII(第三代单分子实时荧光测序技术)结合Illumina HiSeq2500深度测序,根据菌株具体情况制定最优策略,最终得到一条完整的基因组序列(补齐所有的gaps)。
(3)细菌重测序:针对已知基因组序列的细菌,采用HiSeq深度测序,后续分析不依赖于组装,关注基因组变异情况(包括SNP和InDel等),是群体研究的首选。
服务流程
收费标准
测序项目 | 费用(RMB) | 周期(工作日) |
细菌精细图 | 1.6万(基因组< 5M);2.2万(基因组>5M) | 30 |
细菌完成图 | 3.0万(基因组< 5M);4.5万(基因组>5M) | 50 |
细菌重测序 | 0.2万/1M基因组 | 20 |
数据分析 | 费用(RMB) | 周期(工作日) |
1. 基因预测 | 150(对于选择测序服务客户,免费) | 5 |
2. 功能注释 | 150(对于选择测序服务客户,免费) | 5 |
3. COG分类 (默认COG数据) | 150(对于选择测序服务客户,免费) | 5 |
4. 代谢通路构建 (默认KEGG数据库) | 150(对于选择测序服务客户,免费) | 5 |
5. tRNA、rRNA预测 | 150(对于选择测序服务客户,免费) | 5 |
6. 基因组岛预测 (只针对完成图) | 200 | 5 |
7. 蛋白亚细胞定位 | 200 | 5 |
8. 比较基因组学分析 8.1 SNP分析 8.2 Indel分析 8.3 Pan-genome分析 8.4 基因组结构分析 (8.4只针对完成图) | 600 | 5 |
9. 次生代谢基因簇分析 (只针对完成图) | 400 | 5 |
10. 基因组圈图绘制 (只针对完成图) | 400 | 5 |
11. 进化树分析 (客户提供≥2个参考基因组链接) | 200 | 5 |
对于所有数据分析(单选或全部),均在5个工作日内完成。