货号: | WLA106a |
保存条件: | -20℃及4℃ |
规格: | 20T |
产品概述:染色质免疫沉淀技术(chromatin immunoprecipitation assay, ChIP)作为最佳的研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法,它的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物,并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过免疫学方法沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,通过对目的片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。
包装信息:
试剂盒组分 | WLA106a (20T) | 保存条件 |
1M 甘氨酸 | 26ml | 4°C |
蛋白酶抑制剂 | 300μl | -20°C |
Buffer A | 20ml | 4°C |
Buffer B | 10ml | 4°C |
Chip Diluiton Buffer | 24ml | 4°C |
ProteinA beads | 2.4ml | 4°C |
RNA Polymerase II抗体 | 40μl | -20°C |
正常血清 IgG | 40μl | -20°C |
Low Salt Wash Buffer | 20ml | 4°C |
High Salt Wash Buffer | 20ml | 4°C |
LiCl Wash Buffer | 20ml | 4°C |
TE Buffer | 40ml | 4°C |
RNaseA | 20μl | -20°C |
Proteinase K | 20μl | -20°C |
注意事项:
1. 甲醛固定时,时间不宜过长,10min即可。
2. 超声时温度不能过高,最好冰浴进行;防止样品起沫。
3. 样品中加入填料后离心转数不能过大,防止填料破碎。
4. 蛋白酶抑制剂使用前室温融化。
操作流程:
1. 每皿细胞(9ml 培养液),加入243μl 37%甲醛,使得甲醛的终浓度为1%,室温摇床10min。
2. 终止交联:加1M 甘氨酸1.26ml,使其终浓度为0.125M 室温摇床5min。
3. 吸尽培养基,用预冷的PBS洗两次后,加适量蛋白酶抑制剂(2ml PBS中加入5 蛋白酶抑制剂),用细胞刮收集细胞,2000rpm,4℃离心5min。
4. 弃上清,加入1ml Buffer A,冰上放置10min,3000-5000rpm离心5min。
5. 弃上清,加入400μlBuffer B(每100μlBuffer B中含有106细胞)重悬后加入5μl蛋白酶抑制剂。
6. 超声破碎。一般来说,300W超声10s,间隔30s,12次。12000rpm,4℃离心20min。取20μl 上清电泳检测,抹带集中在500-1000bp左右即可。
7. 样品分成三组,每组100 ,A:实验组 ; B:阳性对照组 ; C:阴性对照组,剩余样品可放置-80℃保存。
8. 在三组样品中分别加入900μlChip Diluiton Buffer。
9. 准备ProteinA beads,用1ml PBS 清洗三次(3000rpm离心1min)后保存备用,此步可提前准备。
10. 三组样品中各加入60μlProteinA beads, 4℃颠倒混匀1-2h。
11. 混匀后4℃静置10min,3000rpm离心1min。
12. 取上清,每组样品取20 进行nput实验,-20℃保存。
13. 实验组中加入1-10μg抗体;阳性对照组加入1μgRNA Polymerase II抗体;阴性对照组加入1μg正常血清IgG,4℃过夜孵育。
14. 三组样品中再加入60μlProteinA beads, 4℃颠倒混匀1-2h。
15. 洗涤ProteinA beads 依次用下列溶液清洗沉淀复合物。清洗步骤为:加入1ml 预冷溶液,在4℃混匀10min,3000rpm离心1min,除去上清。
a. Low Salt Wash Buffer,1次。
b. High Salt Wash Buffer,1次。
c. LiCl Wash Buffer,1次。
d. TE Buffer,2次。
16. 每管加入100μlElution Buffer(100μl10%SDS+100 1M NaHCO3+800μldμldH2O),室温颠转10min后3000rpm离心1min,收集上清。重复洗脱1次,终体积200μl。
17. 取出nput实验样品,室温融化后加入180μlElution Buffer。
18. 解交联。每管中加入8μl5M NaCl,混匀,65℃解交联过夜。
19. 解交联结束后,每管加入1μlRNaseA,37℃孵育1h。
20. 每管加入4μl0.5M EDTA,8μl1M Tris-HCl(PH=6.5),1μlProteinase K,45℃孵育2h。
21. DNA片段回收(WLA052a DNA凝胶回收试剂盒)。