提供商: | OmegaGenetics |
服务名称: | 微卫星(STR)分析-SSR |
规格: | 微卫星—STR跑板 |
微卫星标记(Microsatellite)也称为短串联重复序列(STR)或简单重复序列(SSR)是指以少数几个核苷酸(多数为2-4个)为单位多次串联重复的DNA序列。由于重复单位及重复次数不同,使其分布具有很大的差异性,构成了STR的遗传多态性,并按孟德尔规律呈共显性遗传。由于STR具有种属特异性、适合于复合扩增、适合于降解、微量样品的检测等特性,使其在人类基因组遗传图谱的制作,种质鉴定,亲缘关系分析,法医学个体识别和亲权鉴定,筛选目的基因和基因诊断,器官移植,基因定位等领域都得到了广泛的应用。
微卫星位点通常通过PCR扩增,扩增产物通过电泳分析并根据大小分离等位基因进行检测。PCR扩增后的等位微卫星可以用多种方法检测,传统采用聚丙烯酰胺凝胶电泳加放射显影或银染的方法,费时费力效率低。我们利用ABI遗传分析仪对荧光标记DNA片段进行检测,加上分子量内标进行DNA片段长度计算,使STR分型变得高效快捷,结果也更加精确可靠。基于测序仪平台,我们同时提供的整体微卫星(STR、SSR)分型服务,包括单倍型分析、遗传连锁分析或构建遗传连锁图谱等。
二、服务内容
1. 根据相关背景资料,确定试验方案
2. 预试验确定实验条件(基因组DNA提取;荧光标记引物设计、合成 )
3. 检测位点 PCR 扩增
4. 毛细管电泳检测
5. 数据处理与分析【Genemapper软件】
三、服务说明
1 您可以提供相关基因座已经扩增好的PCR 产物,我们对其直接进行STR 分型检测
2 您亦可以提供试验材料,比如生物组织、血液或基因组DNA;
3 若所送样品为基因组DNA 或质粒DNA,样品要求:DNA 浓度≥20ng/ul,体积≥10ul(若位点数较多,则按1ul/位点准备),纯度 OD 260/280 在1.7~1.9 之间。
4 若样品为血样,样本要求:血液样品,体积大于 500ul,用EDTA抗凝,送样过程中请注意保持低温,防止DNA降解;血斑样品,9-25mm2 大小的血斑两个以上。对每个血样或血斑样本将收取DNA 提取费。若分型样品为细胞、组织样品,样本要求:细胞≥105,组织≥100mg,黄豆大小。
四、交付内容
1. 原始数据,包括Genemapper分析图谱(PDF格式)及fsa格式峰型图
2. 各峰的相对分子量等具体信息(Excel格式)
3. 完整实验报告(包括引物序列、扩增反应体系,实验步骤等)
4. 数据分析软件及使用说明
5. 其他服务
公司可以提供 SSR 跑 PAGE 胶,及 ISSR 跑琼脂糖分析,具体事宜请咨询
五、服务价格、周期
编号 | 服务名称 | 内容说明 | 周 期 | 价 格 |
M0022 | 微卫星—单色检测 | 单色检测,数据分析至size等 | 5工作日 | 600元/96孔板 |
M0023 | 微卫星—双色检测 | 多色检测,数据分析至size等 | 5工作日 | 800元/96孔板 |
M0024 | T-RFLP跑板 | 上机检测,数据分析 | 5工作日 | 600元/96孔板 |
M0025 | 微卫星—STR跑板 | 上机检测,不分析数据等 | 5工作日 | 400元/96孔板 |
M0026 | 微卫星—普通引物合成 | 2 0D,PAGE纯化,不超过30碱基 | 5工作日 | 50元/对 |
M0027 | 微卫星—荧光引物合成 | FAM 2OD | 7工作日 | 300元/对 |
HEX 20D | 7工作日 | 400元/对 | ||
TAMRA 2OD | 7工作日 | 400元/对 | ||
ROX 2OD | 7工作日 | 500元/对 | ||
M0028 | 微卫星—引物设计 | 不含验证 | 2工作日 | 50元/对 |
M0029 | 微卫星—引物开发 | 开发多态性引物,拿5-10个样本验证 | 3-4周 | 询价 |
M0030 | 微卫星—STR/SSR分型检测 | 引物设计合成、扩增、预实验、检测 | 3-4周 | 询价 |
M0031 | 微卫星—数据分析 | 关联性分析、构建遗传图谱等 | 2-4周 | 询价 |