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Label-free非标定量

产品价格: ¥3000.00

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发货时限:
暂无
所在地区:
中国北京
有效期至:
长期有效
最后更新:
2021-05-24 01:30:05
浏览次数:
42

产品详情

品牌名称:
提供商: 北京青莲百奥生物科技有限公司
服务名称: Label-free非标定量
规格: 每个样本1个馏分,增加馏分价格翻倍
一、技术简介
    蛋白质非标记定量技术(label-free)是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。Label-free的技术优势就在于蛋白质不需要进行标记,所需样品总量少,耗费低。
 
二、技术原理
         非标记定量蛋白质组学已成为越来越重要的质谱定量方法,按照其原理主要分为两种:  Spectrum counts类的非标记定量方法:发展比较早,已经形成多种定量算法,但主要原理都是以MS2的鉴定结果为定量基础,各种方法的差别在于后期算法在大规模数据上的修正。  另一种非标记定量方法的原理是以MS1为基础,计算每个肽段的信号强度在LC-MS色谱上的面积积分。
 
三、实验流程
 
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四、应用特点
● 对液相色谱串联质谱的稳定性和重复性要求较高。 
●无需昂贵的同位素标签做内部标准,实验耗费低。 
●对样本的操作也最少,从而使其最接近原始状态,并且不受样品条件的限制,克服了标记定量技术在对多个样本进行定量方面的缺陷。
 
 
同位素标记 非同位素标记
样本标记同位素 样本非标记
样本量限制,ICAT(2),iTRAQ(8)等 样本无限制
在大样本过程中,难于跟踪蛋白丰度 易跟踪蛋白丰度
多数肽段难于识别 能够识别大多数肽段
难于识别和定量低丰度蛋白 能够鉴别低丰度肽段
需提前进行二级质谱蛋白鉴定 可以鉴定差异后再进行二级质谱蛋白鉴定
实验重现性高 实验重现性低
 
五、信息分析
 
差异基因列表 样本之间相关系数热图
上下调基因表 层次聚类热图
差异基因数目比较表 主成分分析图
上下调基因数目比较表 K-均值聚类图
鉴定蛋白理化性质表 GO功能富集图
K-均值聚类类别表 差异基因火山图
时间序列的相关系数表 差异基因的KEGG通路图
GO功能表(仅限于UNIPROT来源的库) 网络图
信号通路Mapping表 染色体定位图(若有染色体定位信息)


信息分析内容
数据产出统计
蛋白质鉴定结果
蛋白质定量结果
蛋白质GO分析
蛋白质COG分析
蛋白质Pathway代谢通路分析
差异蛋白GO富集分析
差异蛋白的Pathway富集分析
重复性分析(仅针对有重复设计的项目)
多样品间表达模式聚类(适用于样本数≥3的项目)
定制化信息分析
蛋白质组与转录组关联分析
 
六、样本要求
 
样品类型 样品要求
 蛋白质提取物 浓度 >1μg/μl,蛋白质总量 >200μg
组织样品  动物、微生物组织湿重>10mg;植物鲜嫩组织>100mg
体液样品  血液体积>500μl
细胞样品 细胞量>10的7次方



 


 
 
 

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