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Small RNA测序服务

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中国北京
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长期有效
最后更新:
2021-05-19 01:30:07
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23

产品详情

品牌名称:
提供商: illumina
服务名称: Small RNA测序服务
规格: 10M reads
Small RNA测序是基于Illumina HiSeq2500测序平台,研究某一物种特定组织在特定状态下的所有已知Small RNA,也可发现新的或该物种特有的Small RNA并预测其靶基因,为研究Small RNA的功能及此物种的基因调控机制提供了有力工具。Small RNA主要包括微小RNA(miRNA)、小干扰RNA(siRNA)、与piwi相互作用的RNA(piRNA)三类。

技术优势
1、 高通量,低成本:一次测序可得到数百万条序列,单次运行可经济分析多个样品;
2、高分辨率:基于高通量测序技术能够直接从单核苷酸水平研究小分子RNA,不存在传统芯片杂交的荧光模拟信号带来的交叉和背景噪音问题,非常有利于区分相同家族以及序列极为相似的不同sRNA;
3、高精准度:reads能覆盖sRNA全序列,可成功检测低丰度表达的miRNA;
4、通用平台,不依赖已知信息:可进行任何物种的sRNA序列测定,既能鉴定已知的miRNA,又能预测新的miRNA;
5、可重复性高:深度测序保证了抽样随机性,重复性非常好,无需重复实验。

样品要求
1、样品类型:完整且无污染的总RNA;
2、样品需求量(单次):≥10 μg;
3、样品浓度:≥200 ng/μL;
4、样品纯度:OD260/280 =1.8~2.2;OD260/230≥2.0;28S:18S≥1.5;RIN≥8.0;23S:16S≥1.5 (此项要求只针对原核生物)。
 
参考文献
[1]Li D, Wang L, Liu X, et al. Deep Sequencing of Maize Small RNAs Reveals a Diverse Set of MicroRNA in Dry and Imbibed Seeds [J]. PloS one, 2013.
[2]Yang X, Wang L, Yuan D, et al. Small RNA and degradome sequencing reveal complex miRNA regulation during cotton somatic embryogenesis [J]. Journal of experimental botany, 2013.
 [3]Li F, Pignatta D, Bendix C, et al. MicroRNA regulation of plant innate immune receptors[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2012, 109(5): 1790-1795.
 

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