提供商: | 湖南科互生物医药有限公司 |
服务名称: | DNA甲基化测序数据分析 |
服务项目
DNA甲基化作为表观遗传修饰的主要方式,它不改变DNA的一级结构,却在细胞的发育、基因的表达、及基因组的稳定性中起着重要的作用。本公司可完成完整的DNA甲基化芯片分析流程:
1. DNA甲基化数据标准化分析:对不同平台DNA甲基化芯片原始数据处理、标准化、信号提取,物种不限。
2. 甲基化的染色体分布图:甲基化在各个染色体的分布情况
3. DNA甲基化聚类图:为了展示甲基化水平在样本中高低甲基化的分布,用甲基化水平的值来做聚类/热图的展示。
4. 差异甲基化基因的功能分析(GO分析):GO-Analysis对差异甲基化基因等按GO分类,并对分类结果进行基于离散分布的显著性分析、误判率分析、富集度分析,得出与实验目的有显著联系的、低误判率的、靶向性的基因功能分类,该分类即导致样本性状差异的最重要的功能差别。通过该分析有可能找到导致甲基化水平变化的重要功能,并且找到该功能所对应的基因。
5. 差异甲基化基因的通路(pathway)分析:信号通路(Pathway)是多个蛋白质间相互作用,共同调节细胞功能和代谢活动的过程。而信号通路分析是通过对差异基因按照Pathway的主要公共数据库KEGG和Biocarta来进行分类,对Pathway中的基因进行基于离散分布的显著性分析,得到与实验目的有显著联系的Pathway 分类,该分类即导致样本性状差异的最重要Pathway。
6. 转录因子预测分析:通过对差异甲基化区域转录因子的预测,得到调控甲基化的转录因子。
7. 甲基化芯片与表达谱芯片联合分析:通过与基因表达谱进行联合分析,采用cross_plot来展示甲基化与mRNA层面的相关性,找到与甲基化负相关的mRNA。
技术展示
文献:《DNA-methylation in C1R is a prognostic biomarker for acute myeloid leukemia 》期刊:《Clin Epigenetics》
IF值:4.987
文献:《Integrated analysis of DNA methylation and mRNA expression profiling reveals candidate genes associated with cisplatin resistance in non-small cell lung cancer》
期刊:《Epigenetics》
IF值:4.394
服务流程
公司承诺
信息保密:严格杜绝您的项目信息泄露,如有泄露,3倍服务金额赔付
实时跟进:项目进度及时汇报,让用户清楚项目的每一步
售后无忧:如果项目有问题,我们将负责到底
联系方式
咨询热线:400-1515-810
电子邮件:scirplus@vip.qq.com
微信号:SuperSciencePlus