货号: | HZ10043 |
供应商: | 上海沪震生物科技有限公司 |
数量: | 大量 |
保质期: | 1年 |
保存条件: | 4度保存和运输 |
有效shRNA筛靶套餐
服务简介:
软件设计或者现有shRNA 库通常可以提供3-5条shRNA ,但是在RNA干扰主体实验中,一般用1-2条shRNA进行实验即可。因此,在进行RNA干扰主体实验之前,有必要进行有效shRNA的筛选,在3-5条shRNA中筛选1-2条干扰效率最高的shRNA ,以进行后续实验。
如果目的细胞的质粒转染效率较高( 大于70%) ,则有效shRNA的筛选可以直接在日的细胞中进行,即所谓的"内源筛靶" 。而如果目的细胞的质粒转染效率一般(小于70%) ,则有效shRNA 的筛选可以在293 、CHO等工具细胞中进行,即所谓的"外源筛靶"。
无论是内源筛靶,还是外源筛靶,其基本步骤都包括:
- shRNA表达载体构建;
- 目的基因过表达载体构建( 内源筛靶可省293等工具细胞中如有目的基因的高表达,亦可省去此步骤);
- 细胞培养及转染;
- RNA干扰效率检测(RT-PCR 、Westem-blot等)。
本公司根据以上服务内容,推出有效shRNA筛靶套餐,包括有效shRNA内源筛靶套餐(S2003) 、有效shRNA外源筛靶套餐(S2004) ,您可以根据需要订购相应的筛靶套餐。
TIPS :什么情况下选择外源筛靶?
- 目的细胞不易得到,例如原代细胞、稀有细胞株,或者目的细胞暂时还未到位;
- 目的细胞转染效率低(转染效率低于70%);
- 目的细胞需要诱导才能表达靶基因;
- 目前尚无靶基因的抗体。
如果存在上述情况,您可以选择外源筛靶。选择外源筛靶时,有效shRNA的筛选通常在293 、CHO等工具细胞中进行。这些细胞培养容易、质粒转染效率高,是很好的研究平台。
如果293等工具细胞中有目的基因高表达,则可直接导入shRNA表达载体进行筛选。而如果293等细胞中目的基因表达量低,则需要额外共转染一个目的基因的过表达载体,人为地创造一个目的基因高表达环境,以便于shRNA的筛选和验证。在表达目的基因时,还可以带入EGFP 、RFP等荧光标记,或者Flag 、Myc 、His等标 签,以便于后续RNA干扰效果的检测。