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过表达实验
(1S,3R)-3-(tert-butoxycarbonylamino
PE-Cy3标记的羊抗大鼠IgG
Agilent 2100生物芯片
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snp芯片
小rna芯片
cgh芯片
比较基因组测序芯片（
微生物研究服务解决方案
测序服务推荐
1、DNA de novo Seq
De novo 测序也叫从头测序，不需要任何基因序列信息即可对某个物种进行测序。用生物信息学的分析方法对序列进行拼接、组装，从而获得该物种的基因组序列图谱。目前广泛应用于从头解析未知物种的基因组序列、基因组成、进化特点等。全基因组序列图谱完成后，可以构建该物种的基因组数据库，为该物种的后基因组学研究搭建一个高效的平台；为后续的基因挖掘、功能验证提供DNA序列信息。
上海伯豪利用新一代高通量测序技术及SMRT技术，不仅能进行全基因组从头测序，得到物种的完整基因组序列信息，而且能够得到碱基的修饰信息，帮您完成物种基因组序列图谱及碱基修饰图谱。技术路线：HiSeq测序
基础分析：原始数据处理、数据过滤及统计、序列拼接及拼接质量评估、基因预测及注释 、ncRNA预测、repeat预测、碱基修饰检测、修饰位点motif预测。
高级分析：不同物种比较基因组序列分析、图形展示等。2、DNA重测序
上海伯豪利用Illumina HiSeq2500系统进行全基因组重测序，并通过生物信息学的手段，分析不同个体基因组间的差异， 同时完成注释，从而帮助您在全基因组水平上扫描并检测特定群体的重要遗传性状相关位点。
数据分析：
基础分析：原始数据处理、数据过滤及统计、Box Plot图评估数据质量、序列mapping分析、SNV检测及注释、InDel检测及注释、SV精细分析
高级分析：De novo拼接及质量评估、拼接结果大片段缺失与插入检测、插入片段基因预测注释、插入片段拷贝数及插入位置检测、比较基因组图形展示等。3、基于参考基于组修复的RNA-Seq转录组是特定物种、组织或细胞在特定生理状态下转录的所有RNA的集合，包括mRNA和非编码RNA（Non-coding RNA）。上海伯豪可以为您提供微生物基于参考基于组修复的RNA-Seq，我们主要针对mRNA和部分ncRNA 进行分析，在全面快速获得基因表达谱变化的同时，还可以通过测定的序列信息精确地分析转录本的cSNP及结构变异，另外对于检测低丰度转录本和发现新转录本具有其独特的优势。
技术路线：
数据分析：
基础分析：原始数据处理、数据过滤及统计、测序序列质量评估、基因组比对、基因表达定量分析、表达相关性分析、基因差异表达分析、差异基因GO富集分析、差异基因KEGG富集分析。
高级分析：新基因预测、新基因表达定量、新基因差异表达分析、ncRNA预测、ncRNA表达定量、ncRNA差异表达分析、ncRNA靶基因预测、差异ncRNA靶基因的GO富集分析、差异ncRNA靶基因的KEGG富集分析、差异ncRNA与差异基因的共表达分析等。
芯片服务推荐1、微生物表达谱芯片服务
微生物基因表达谱芯片可使科研工作者实现在mRNA水平上同时平行研究成百上千乃至上万条基因的表达关系。它的主要用途是用于大规模分析一定的微生物对象在特定生物过程中（如发育、分化、凋亡等）基因表达变化的全面信息。
上海伯豪可为客户提供Affymetrix、Agilent等微生物基因表达谱芯片服务。
Affymetrix：酵母、大肠杆菌、铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌。Agilent：酵母、大肠杆菌、稻瘟菌。
此外，上海伯豪还可以为广大科研工作者提供全套的表达谱芯片分析服务，内容包括：归一化、差异基因筛选、火山图、主成分分析、样本相关性、聚类分析、基因功能分析、功能层次网络构建、信号通路分析、信号通路调控网络构建、基因相互作用网络图、转录因子分析及网络构建、共表达网络构建、时间序列的共表达网络、分子建模预测（MAKER预测）。2、定制芯片服务上海伯豪可以为广大客户提供各类芯片定制服务。
已经完成的e-aaray微生物清单：烟曲霉、乳酸杆菌、丙***丁醇梭菌、猪链球菌、马尔尼菲青霉菌、布鲁氏菌、拜氏梭菌、胸膜肺炎放线杆菌、克雷伯氏肺炎菌、沙雷菌、希瓦氏菌、耻垢分枝杆菌、副猪嗜血杆菌、谷氨酸棒杆菌、禾谷镰刀菌、结核杆菌、绿脓杆菌、沙门氏杆菌、水稻纹枯菌、苏云金芽孢杆菌、铜绿假单孢菌、弯曲杆菌、阿维链霉菌、天蓝色链霉菌、林可链霉菌、始旋链霉菌、集胞藻……
De novo sequencing 应用案例
- 完成曼氏血吸虫的测序
