什么是适配体 适配体是一类长度小于100nt,具有一定序列的单链寡核苷酸。经过自身形成的三维结构,类似于抗体与靶标实现高亲和力、高特异性的识别。这种新型的识别分子目前被广泛应用于诊断、纯化和治疗领域。2012年全球适配体总市值达到了20.99亿美元,并保持着106.3%的高速年增长。预计到2017年,全球适配体市场可以达到37亿美元 [1]。
适配体与抗体的主要区别
适配体的主要成分是核酸,热稳定性较抗体好。能通过体外筛选获得,对靶标几乎没有任何的要求,而抗体则一般要求抗原具有较强的免疫原性,并且不能对宿主动物产生毒性。因此,适配体可以识别的靶标种类十分广泛( 包括蛋白,多肽和小分子),也可以应对病毒、耐药菌、耐药细胞等高突变靶标。无法获得抗体的靶标往往可以找到与之识别的适配体分子。适配体主要通过化学合成的方式进行生产。这使得生产成本低,而且产物纯度高,批间重复性好,免去了抗体每一批都需要经过滴度测定的困扰。适配体可以很容易的进行各种生物和化学修饰,是抗体望尘莫及的。
适配体的筛选流程——SELEX
适配体主要通过SELEX体外筛选技术获得。筛选的起点是一个人工设计的含有多达1015种不同序列分子的文库。这些分子与靶标孵育结合后,结合于靶标的分子经过分离,再扩增,可以形成一个次级文库,投入到新一轮次的筛选。一般经过6~15个轮次,就可以获得与靶标特异性结合的分子。经过克隆和测序,可以明确其序列并用于生产[2]。
一个标准的筛选轮次一般需要1~2天时间。完成整个筛选,克隆和序列鉴定,全程仅需1~2个月。相比较而言,获得一个单克隆抗体一般需要6个月的时间。较短的研发周期也意味着较低的研发成本。
在适配体中掺入修饰碱基是适配体技术近年来最重要的进展之一。掺入的修饰碱基使得适配体具有更好的三维空间结构与靶标分子结合,从而筛选的成功率大大提升,并且降低了适配体与靶标之间的解离速率。伯豪适配体中心通过自主研发,合成了独特的侧链修饰碱基,并建立了具有自主知识产权的相关筛选平台。我们相信,这将推动适配体在国内研究和应用领域的快速发展。
定制筛选服务
伯豪适配体中心经过数年的技术攻关,积累了丰富的筛选经验。目前推出了一代、二代和RNA三大适配体筛选服务平台。服务平台具有标准化的流程,并与多样检测技术配套,可以快速评估和鉴定已知适配体的专一性和亲和力。这些技术包括ELASA检测,免疫杂交,免疫沉淀,流式,SPR等。合理配套的系统化筛选平台,可为客户进行针对蛋白靶标的定制化筛选服务。
我们也将在近期推出细胞靶标和小分子靶标筛选,以满足不同科研需求。适配体中心希望利用我们领先的筛选平台,配合国内科研团队能够更好的挖掘和开发适配体潜力,助力适配体在国内科研和临床各领域的广泛应用。
我们可以与您进一步探讨服务的具体细节和内容,制定筛选策略。在您提交筛选所需的试剂包括蛋白靶标之后,伯豪适配体中心实施筛选,获得与您的靶标特异性结合的适配体,并在商定的时间内(标准周期为2个月)将产物寄到您的手中。同时,我们也随时欢迎客户与我们联系,提供你们的建议和需求,商讨潜在的合作意向。
适配体中心介绍
生物芯片上海国家工程研究中心下属的上海伯豪医学检验所适配体中心,与美国哈佛医学院资深教授多年合作,致力于共同开发适配体筛选和应用技术,利用其独特的的特性进一步发展科研和临床产品。中心还与华山医院消化疾病研究所建立了长期合作关系。
中心通过多年的自主研发,目前已建立了国际领先的蛋白靶标适配体筛选、优化和鉴定平台。国内唯一的二代筛选平台可以大幅提高筛选的成功率。中心将努力推动适配体技术在科学研究,临床诊断和药物开发领域的应用,向研究院校和科研人员提供技术服务。
参考文献
[1] King M. Global aptamer market to increase by a massive 106.3%. Companies and Markets, Vertical Edge Limited, 2012.
[2] Stoltenburg, R., C. Reinemann and B. Strehlitz, SELEX--a (r)evolutionary method to generate high-affinity nucleic acid ligands. Biomol Eng, 2007. 24(4): p. 381-403.
FAQs
目前推出的服务主要针对多肽和蛋白类靶标,细胞靶标的筛选服务将在近期推出,敬请关注。
靶标之间各不相同,根据文献报道,蛋白靶标的适配体亲和力一般能达到nM级别。我们筛选的产物表现往往更好,可以达到pM级别。
一般情况下, 我们需要客户提供纯度超过90%的靶标,以及与之区别的用于反向筛选的类似物。反向筛选是提高适配体特异性的重要步骤。靶标和类似物需要的量一般不少于1nmol。
筛选产物往往包含上百个克隆,由于成本的限制,我们标准流程只能提供鉴定结果最好的3个克隆。如果客户对于更多的克隆有需求,可以支付额外的费用订购。产物经化学合成后,主要通过干粉的形式交到客户手中,其中包含产物的量为2OD。产物如果用完也可以向我们再次订购。科研用途的克隆序列也可以一并交给客户用于论文的发表。但是,伯豪医学检验所保留对克隆序列的知识产权。
伯豪医学检验所保留对所有筛选克隆序列的知识产权。如果客户需要知识产权转让,我们愿意协助***相关的手续,并收取相关的转让费用。
关于适配体研究的更多内容见:
伯豪学院视频:核酸适配体——新兴的化学抗体
http://college.shbio.com/index.php?c=content&a=show&id=249