技术简 技术介绍
Reduced Representation Bisulfite Sequencing(RRBS)是一种准确、高效、
经济的DNA 甲基化研究方法,通过酶切富集启动子及CpG 岛区域,并进行
Bisulfite 测序,同时实现DNA 甲基化状态检测的高分辨率和测序数据的高利用
率。DNA 甲基化研究一直是疾病研究的热点,与基因表达、表型性状息息相关。
RRBS 作为一种高性价比的甲基化研究方法,在大规模临床样本的研究中具有广
泛的应用前景。利用RRBS 可以实现多个样本的比对基因组分析。
技术优势:
1. 直接针对酶切富集启动子区域以及CpG 岛区域进行甲基化研究
2. DNA 甲基化状态检测的高分辨率和测序数据的高利用率,有效增加了测序深
度
3. 可以与单细胞测序技术结合,进行细胞细胞RRBS 测序
技术路线
样品技术路线
样本要求
1)样品总量:≥ 3 μg DNA(常规样本),≥ 5 μg DNA(FFPE 或降解DNA
样本);
2)样品纯度:OD260/280 = 1.8-2.0;
3)样品完整性:DNA 无明显降解与蛋白污染,需提供凝胶电泳检测胶图;
数据分析
1. 测序质量评估(QC)
2. 测序序列与参考序列比对
3. 序列比对的甲基化情况
4. 甲基化水平计算
5. 差异甲基化区域分析
6. 差异甲基化位点功能分析