翻译后修饰是蛋白质调节功能的重要方式,在生命现象的许多关键调节机制中,蛋白质的***酸化是重要的翻译后修饰,它与信号传导,细胞周期,生长发育以及癌症机理等诸多生物学问题有密切关系。因此,对于蛋白质***酸化的研究对阐明蛋白质的功能具有重要意义。武汉华美生物蛋白质组平台根据客户需求,可提供***酸化蛋白质组全谱鉴定技术服务。
***酸化蛋白质组全谱鉴定以组织、细胞等较为复杂样本的为研究对象,目的在于鉴定样品中发生***酸化的蛋白质以及相应的位点。对蛋白样本进行酶解,TiO2或IMAC富集***酸化肽段,5600-plus质谱检测,利用得到的质谱谱图与相应数据库搜索比较,从而得到肽段序列结果,同时通过生物信息软件计算出***酸化位点。
定量方面,***酸化蛋白质常常选择iTRAQ定量或SWATH定量方法。
图:TiO2或者IMAC富集***酸化流程图。
我公司的技术特点
l 高效率、高准确性:单次实验可鉴定上千种***酸化位点,快速构建某种细胞或者组织的***酸化蛋白修饰谱。精确定位到单个氨基酸位点的***酸化修饰。
l 碎裂模式选择:提供目前性能最佳的TOF-CID碎裂模式,提高***酸化位点鉴定准确性。
l 定量准确:该方法可以较为准确的发现多个样品间同一蛋白质***酸化位点的差异;
信息分析内容
l ***酸化位点鉴定,依据位点打分过滤,可靠性评估;
l ***酸化肽段和***酸化蛋白质鉴定;
l ***酸化位点、***酸化肽段差异表达分析;
l ***酸化蛋白质GO 功能注释、Pathway代谢通路注释;
l 差异***酸化蛋白GO、Pathway功能富集分析。