在以往蛋白组学研究过程中先进行二维(2D)凝较电泳,切取蛋白点,再用质谱方法鉴定蛋白点中的蛋白质。这种方法既不是非常敏感,也不是非常精确。仅仅知道蛋白质的身份并不足以对蛋白质给出最终定论,因为蛋白质的浓度对于实现其在细胞中的功能来说极其重要,一种特殊蛋白质在浓度上的变化,就能预示细胞的突变过程。因此对蛋白质的相对和绝对浓度进行测量,是很重要的事情。iTRAQ技术可以对任何类型的蛋白质进行鉴定,包括高分子量蛋白质,酸性蛋白质和碱性蛋白质,而2D凝胶电泳对这些蛋白质却束手无策。而且,2D凝胶电泳无法对膜蛋白那样的不溶性蛋白质进行分析,但是iTRAQ标记系统和质谱法联合使用可解决这些问题。
iTRAQ的操作程序一般如下:将蛋白质裂解为肽段,然后用iTRAQ试剂进行差异标记,再将标记的样本相混合,这样就可以对其进行比较。与样本结合后,通常用用2D液相色谱串联质谱进行后续的分析。在质谱分析鉴定特殊肽离子片断结构的基础上,采用美国应用生物系统公司的软件包MASCOT和Protein Pilot对每一个肽段进行鉴定。
同时本公司还可以提供双向电泳(2-DE)、荧光差异凝胶双向电泳(DIGE)、蛋白质肽指纹图谱鉴定(PMF)、串联质谱鉴定(MALDI-TOF/TOF)、ESI源LC-MS/MS、Shotgun混合蛋白鉴定、蛋白质De-novo测序、蛋白质***酸化和二硫键位点分析、蛋白质精确分子量测定、western-blot、免疫组化、病理学检测、荧光定量PCR、生物信息学分析等服务。
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