提供商: | 嘉美实验 |
服务名称: | 分子生物学:基因组 DNA 提取实验服务 |
实验技术简介:DNA、RNA和核苷酸都是极性化合物,一般都溶于水,不溶于乙醇、氯仿等有机溶剂,它们的钠盐比游离酸易溶于水,RNA钠盐在水中溶解度可达40g/L。DNA在水中为10g/L,呈黏性胶体溶液。
在酸性溶液中,DNA天然状态的DNA 是以脱氧核糖核蛋白(DNP)形式存在于细胞核中。要从细胞中提取DNA 时,先把DNP抽提出来,再把P除去,再除去细胞中的糖,RNA 及无机离子等,从中分离DNA 。 DNP和RNP在盐溶液中的溶解度受盐浓度的影响而不同。DNP在低浓度盐溶液中,几乎不溶解,如在0.14 mol/L的氯化钠溶解度最低,仅为在水中溶解度的1%,随着盐浓度的增加溶解度也增加,至1mol/L氯化钠中的溶解度很大,比纯水高2倍。RNP在盐 溶液中的溶解度受盐浓度的影响较小,在0.14mol/L氯化钠中溶解度较大。因此,在提取时,常用此法分离这两种核蛋白。
苯酚/氯仿作为蛋白变性剂,同时抑制了DNase的降解作用。用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。离心分层后取出水层,多次重复操作,再合并含DNA 的水相,利用核酸不溶于醇的性质,用乙醇沉淀DNA 。此法的特点是使提取的DNA保持天然状态,真核细胞DNA的分离通常是在EDTA及SDS一类去污剂存在下, 用蛋白酶K消化细胞获得。
实验操作流程:
从全血中提取DNA
1、溶血:加300ul的肝素或EDTA二钠抗凝的全血到含RBC Lysis Solution 900ul 的1.5ml EP管, 室温静置1min,期间,轻轻颠倒混匀10次。13000 ~16000 g离心20s。
2、弃上清液,将管底的白色沉淀用枪头吹散,使白细胞在残留的液体中悬浮。
3、加300ul的Cell Lysis Solution于EP管中, 充分混匀。
4、加100ul的Protein Precipitation Solution于EP管中, 充分混匀,13000 ~16000g离心3min.
5、取上清液,加300ul的异丙醇,充分混匀颠倒50次,可见白色絮状沉淀,13000 ~16000 g离心1min 。
6、弃上清液,加入70%的酒精500ul,13000~16000 g离心1min 。
7、弃上清液,加入DNA Hydration Solution 50ul, 充分混匀,65℃5min使DNA 完全溶解。
8、紫外分光光度计测定OD260/280,比值大于1.8即可。
从组织中提取DNA
9、取液氮冷冻的叶片2-3片, 在液氮冷冻下迅速研磨成粉末。
10、将粉末放入到1.5 ml离心管中,然后加入缓冲液“S”750ul, 充分混匀。
11、将离心管置于65℃水浴中1-2小时,水浴过程中温和混匀几次。
12、取出离心管, 每管加入等体积的酚-氯仿(V/V=1:1)溶液600-800ul,混匀后离心,10000rpm, 10分钟。
13、上清液移入另一离心管中,加入等体积的氯仿,混匀后,10000rpm, 6分钟。
14、将上清液移入另一离心管中,加入0.6倍体积的异丙醇,轻轻混匀,静置一段时间,然后用枪头勾出DNA,并用70%乙醇冲洗2次。
15、勾出的DNA,真空干燥后将其溶于500ul 1×TE中。
16、加入3ul RNA 酶溶液,37℃保温1 小时。
17、加入等体积的酚-氯仿溶液, 轻轻混匀后, 10000rpm离心6分钟。
18、取上清液,加入等体积的氯仿,轻轻混匀后,10000rpm离心6分钟。
19、取上清液,入1/10体积3M醋酸钠,混匀后,加入2倍体积冷的无水乙醇(或95%乙醇)。
20、轻轻混匀静置一会儿后,用枪头勾出DNA, 用70%乙醇冲洗2次后,真空干燥。
21、依所提DNA量加入20-50ul的1×TE溶解DNA。
22、测定DNA 的浓度,取少量样品跑电泳, Agarose 胶的浓度为0.8%。
23、样品在4℃下保存备用。
实验注意事项:
客户提供:
1、细菌、细胞样品需新鲜培养;动物组织、植物组织等样品取样后需液氮速冻。
2、用于提取基因组DNA的血液样品在4℃下可保存一周,-20℃下可保存1个月。
3、实验样品最好使用干冰运输。
交付标准:
结果提供基因组DNA、完整实验报告(电泳照片、OD值测定结果等)
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