提供商: | 嘉美实验 |
服务名称: | 分子生物学:酵母双(单)杂交 cDNA 文库构建实验服务 |
实验技术原理:酵母双杂交技术产生以来,它主要应用在以下几方面:(1)检验一 对功能已知蛋白间的相互作用。(2)研究一对蛋白间发生相互作用所必需的结构域。(3)用 已知功能的蛋白基因筛选双杂交cDNA文库,以研究蛋白质之间相互作用的传递途径。(4)分析新基因的生物学功能,即以功能未知的新基因去筛选文库。
ProQuest系统依靠报告基因的转录激活来鉴定蛋白相互作用。将一个基因克隆到'诱饵'载 体,pDEST32,并和GAL4蛋白的DNA结合域 (DBD)表达为融合蛋白。将第二个基因或者编码可能的相互作用子蛋白的cDNA文库克隆到'猎物'载体,pDEST22,同GAL4的转录激活域 (AD)表达为融合蛋白。当两个蛋白相互作用时,AD和DBD间距离被拉近,从而激活报告基因的表达。
实验操作流程:
1、提取总RNA,分离mRNA,反转录cDNA;
2、将cDNA与pDONR222载体进行BP重组反应,重组产物转化DH10B感受态细胞;
3、甘油保存大肠杆菌文库;
4、提取大肠杆菌文库质粒DNA,制备酵母感受态细胞;
5、大肠杆菌文库质粒DNA转化酵母菌,测定转化效率;
6、收集酵母转化子,测定文库效价;
7、甘油保存酵母菌文库。
使用优点:在拥有相关组织基因文库的情况下
a.可以用来比对病变组织更快的找到突变基因或者导致变异的蛋白,更快的找到攻克方向。
b.可以用作大规模的蛋白筛选,在较短时间内对找到某些药物对相关组织主要的作用蛋白,对于药物的修饰和改进明确方向。
c.可以反复使用,培养时间短,适合大规模筛选使用。
d.作用信号是在融合基因表达后, 在细胞内重建转录因子的作用而给出的,省去了纯化蛋白质的繁琐步骤。
e.检测在活细胞内进行, 可以在一定程度上代表细胞内的真实情况。检测的结果可以是基因表达产物的积累效应,因而可检测存在于蛋白质之间的微弱的或暂时的相互作用。
实验注意事项:
客户提供:
客户构建指定的酵母双杂交cDNA文库,由客户提供组织、细胞或总RNA给我们即可:
1、细胞样本:细胞数量大于1*107 ,总RNA:大于200ug
2、动物样本:大于1g ;植物样本:大于2g
交付标准:
1、酵母双杂交(酵母单杂交)文库质粒、菌液
2、完整项目报告(材料、试剂、仪器、方法、数据分析、实验结果)
其他:
1、RNA的提取(例如异硫氰酸胍法,盐酸胍—有机溶剂法,热酚法等等,提取方法的选择主要根据不同的样品而定)。
2、要构建一个高质量的 cDNA 文库,获得高质量的 mRNA 是至关重要的,所以处理 mRNA 样品时必须仔细小心。
3、由于 RNA 酶存在所有的生物中,并且能抵抗诸如煮沸这样的物理环境,因此建立一个无 RNA 酶的环境对于制备优质 RNA 很重要。
4、文库构建要选择合适的载体,常规用的是λ 噬菌体,这是因为 λ DNA两端具有由12个核苷酸的粘性末端,可用来构建柯斯质粒,这种质粒能容纳大片段的外源DNA。
5、胶回收前电泳槽,电泳板,梳子等都要用1%的HCl浸泡。
6、胶回收时电压要稳定。
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