实时荧光定量PCR(Real-time PCR)
实时荧光定量PCR 实时荧光定量PCR(Real-time PCR)通过连续监测PCR指数扩增期间荧光信号的变化来即时测定 特异产物的含量,并据此推断目的基因的初始量。该方法可以检测细胞、组织或微生物中基因表达变化, 如不同药物浓度处理后相关基因表达水平高低变化等,与常规PCR(RT-PCR)相比,实时荧光 定量PCR具有极高的灵敏度、高度的重复性和极佳的特异性,且后续处理无EB等有害物质的污染,已成为现阶段国际公认的核酸分子定量检测的金标准,在基因表达研究和临床疾病检测等领域已得到广泛应用。服务需知:1、为保证实验的精确性,请客户在取样前与我们取得联系,我公司会派专人去协助取样;客户也可直接提供纯化好的总RNA/DNA(≥ 3 ug/ 样本)。2、请通过 E-mail 提供已知的全长基因序列或GeneBank号。 发送至:info@abigen.com 或QQ传输至:QQ:14928760833、希望提供详细的背景资料:生物物种信息(Human、Mouse、Rat等),DNA/ RNA来源、基因丰度等。荧光定量PCR操作流程(SYBR Green I 法)1、根据目的基因序列设计特异性的引物和荧光探针。2、提取DNA/ RNA,紫外分光光度计检测其完整性和浓度,反转录酶将RNA反转录为cDNA。3、引物预实验,筛选出特异性最强的引物。4、荧光定量PCR,采用双标准曲线法,结合内参与目的基因的CT值,进行实验结果分析。5、实验完成后,提供完整的实验报告结果(含软件分析结果)及引物等相关实验材料。服务内容相对定量 (mRNA表达量分析)基因表达的研究一般采用相对定量的方法。相对定量法必须对样品的目的基因和内参基因同时分别进行定量,然后求出对于内参基因的目的基因的相对量。通过对样品间的目的基因的相对量进行比较,可以对不同样品间的mRNA进行表达量分析。内参基因通常选用表达量相对恒定的Housekeeping Gene,如:GAPDH、β-actin等。通过同时对内参基因的实时检测,可以对样品之间由于起始细胞数不同、或RNA提取效率的不同等造成的RNA量误差进行校正,达到在严格意义上对样品之间的mRNA表达量进行分析之目的。绝对定量(构建标准品) 绝对定量首先必须构建与检测样品目的基因具有相同序列的标准品,本公司服务内容为采用TA克隆的方法构建标准品。使用已知浓度的标准品制作5个点以上的标准曲线后,可以使用标准曲线对未知浓度的检测样品进行绝对量 (起始拷贝数)分析。 SYBR Green I 染料法(一般常用方法)SYBR Green I 是一种与双链DNA小沟结合的荧光染料,SYBR Green I只与双链DNA结合才能发出荧光,而不掺入链中的SYBR染料分子不会发射任何荧光信号,荧光信号与双链DNA分子数成正比,随着扩增产物增加而增加,荧光信号的强度代表了反应体系中双链DNA分子的数量。以SYBR Green I作为检测信号的荧光定量PCR方法称为染料法。TaqMan探针法(检测病毒使用,荧光标记引物,成本相对较高)PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5’端-3’端外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,随着扩增循环数的增加,释放出来的荧光基团不断积累,因此荧光强度与扩增产物的数量呈正比关系,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。以Taqman探针作为检测信号的荧光定量PCR方法称为探针法。样品要求客户需提供组织、细胞、血液等样品材料,或纯化好的总RNA或总DNA,反转录好的cDNA样品,具
荧光定量PCR
服务编号 | 服务内容 | 服务价格 | 服务周期 | 注意事项 |
RT-TJ | 相对定量SYBR GreenI PCR条件优化 | ¥800基因 | 10个工作日 | 需提供NCBI序列号,足量新鲜样品,提供3-5个样品,我们设计引物,摸索条件 |
RT-SYBR | 相对定量SYBR GreenI 染料法---推荐方法 | ¥200/样品•基因 | 10个工作日 | 大多客户首选,需提供NCBI序列号,足量新鲜样品,我们免费设计引物和免费提供内参对照 |
RT-TaqMan | 探针法荧光定量PCR样品检测 | 合成探针¥1200/条;样品检测¥160/样品•基因 | 15个工作日 | 需提供引物序列,标记等,需验证引物合格,样品保证新鲜 |
RT-TA | 绝对定量TA克隆制备标准品 | ¥900/基因 | 20个工作日 | 提供材料和NCBI号 |
Real-time PCR具体实验流(以细胞为例)一.总RNA提取用Trizol法(ABIzol)1.用预冷的无菌PBS洗细胞3次,尽可能吸尽PBS,每培养瓶(细胞总数约为5×106个)加入1ml Trizol。用枪吹打细胞,然后装入预冷的EP管中,室温放置5分钟。2.以0.2ml/ml Trizol的比例加入氯仿,盖紧离心管,用手剧烈摇荡离心管15秒,待充分乳化溶液呈乳白状,室温放置2~3分钟。3.4℃12000xg离心15min。离心后溶液分为三层,由下至上为:淡粉的酚仿层、中间白色蛋白层和澄清的水相,RNA在水相中,约为500µl。4.取上层水相于一新的离心管,按0.5ml /ml Trizol的比例加入异丙醇,室温放置20分钟。5.4℃12000g离心10分钟。RNA沉淀后呈胶状片层。6.弃上清,按1ml /ml Trizol液加入75%乙醇(DEPC水配制)。7.轻轻上下翻转,4℃ 7500xg离心5分钟。8.小心弃上清,室温干燥3~5分钟。9.将RNA溶于30-50ul(根据RNA的量而定)DEPC水中。10.RNA样品长期保存于-80℃冰箱。
二.RNA反转录成cDNA(以ABIGEN M-MLV反转录酶为例):RNA 3µl Oligo(dT) 1µl 5XBuffer 5µldNTP(10mM) 5µlRibonuclease inhibitor 0.5µlM-MLV RT 1µldd H2O(DEPC处理) 9.5µl______________________ 25µl体系以上42℃孵育60分钟,然后70℃ 10分钟, 然后迅速放在冰上。三.PCR1.RT-PCR体系:cDNA 2µl引物1(10pmol/µl) 1µl引物2(10pmol/µl) 1µlBuffer(10X) 2.5µlTaq 0.5µldNTP(10mM) 2µdd H2O 16µl_____________________ 25µl2.Real-time PCR体系:cDNA 2µl引物1(10uM) 1µl引物2(10uM) 1µl2xSYBR mix 10µldd H2O 6µl________ 20µl
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