染色质免疫沉淀 (CHIP)
背景知识
染色质免疫沉淀(CHIP)被用来研究细胞内DNA与蛋白质相互作用,具体来说就是确定特定蛋白(如转录因子)是否结合特定基因组区域(如启动子或其他DNA结合位点)--可能定义顺反组。CHIP还被用来确定基因组上与组蛋白修饰相关的特定位点(即组蛋白修饰酶的靶标)。
技术原理
染色质免疫沉淀原理是在活细胞状态下固定蛋白质--DNA复合物,并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过免疫学方法沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,通过对目的片段的纯化与检测,从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。
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