16S/18S/ITS测序及宏基因组测序
16S宏基因组测序常常采用高通量扩增子测序技术来检测微生物16S rRNA基因的特定高变区。16S MetaVx™是金唯智公司独立研发的微生物菌群高通量测序平台,适用于环境微生物、肠道菌群等样品的细菌和古细菌相对丰度的鉴定。16S MetaVx™体系采用多套引物同时扩增细菌和古细菌的V3、V4和V5 三个可变区,大幅提高当前16S宏基因组学技术的灵敏度和特异性。与常用的16S宏基因组学检测方法相比,16S MetaVx™能够检测出更多的痕量的细菌和古细菌。
除了细菌和古菌的高通量检测,金唯智也提供针对真菌和原生生物的菌群检测服务,主要包括ITS测序和18S测序两种。18S测序主要鉴定真菌及其他原生生物,适用于浮游微生物、土壤微生物等环境微生物,以及共生的真核生物菌群等。而ITS测序主要鉴定真菌,如果样品以真菌为主,或者仅关注样品中的真菌菌群,可以选择ITS测序。请联系金唯智获得关于ITS测序和18S测序的详细信息。
服务选项
16S MetaVx™ (不含真核生物)
环境样品16S MetaVx™测序,使用两个扩增子检测16S基因的V3、V4和V5三个可变区,其中一个扩增子分析V3/V4区,另一个扩增子分析V4/V5区。该项服务适于检测真核生物DNA含量较低的样品。
16S MetaVx™ (含真核DNA)
哺乳动物16S MetaVx™测序,采用一个扩增子检测16S基因的V3和V4可变区。该项服务适于检测真核生物DNA含量较高的样品,此扩增体系去掉了与真核18S基因同源性较高的V5区。
服务优势
金唯智16S/18S/ITS测序及宏基因组测序流程
EXPERIMENTAL DESIGN
1目标区域富集&文库制备
2SEQUENCING
3微生物特性分析
4
技术细节
相对于目前已有的宏基因组16S鉴定平台,金唯智开发的16S MetaVx™测序平台兼具保守性和灵活性,能够覆盖绝大部分细菌菌群,并同时鉴定细菌和古菌。比常规的16S检测更加灵敏,并且更能反映真实的菌群组成和结构。 使用16S MetaVx™测序平台和常用的16S V4区高通量测序平台,在相同条件下,同时对相同的样品进行扩增测序。测序完成,将数据进行归一化。比对结果如下:
金唯智宏基因组学样品提交指南
金唯智的宏基因组学项目可以针对土壤、粪便、空气、水体、动植物体表和体内等任何来源提取的全基因组DNA进行检测,除了已纯化的基因组DNA,也可以提供土壤、粪便、液体和组织等样品。如需获得更详细的样品提交要求,请访问我们的样品提交指南页面。
金唯智16S/18S/ITS测序及宏基因组测序服务标准交付
•原始数据(FASTQ格式)
•项目结题报告
相关服务
Sanger测序
全基因组测序
GLP-Compliant Services
高通量测序平台
金唯智的高通量测序平台包括Illumina HiSeq X Ten,HiSeq,MiSeq,PacBio Sequel和Ion PGM™。
可提供多种测序读长、通量和时间周期选择,满足各类科研及应用需求对成本和速度的差异化需求。
如需了解不同NGS平台的更多相关信息以及推荐平台的规格说明,请访问高通量测序平台页面。
金唯智是Illumina和Ion Torrent认证的测序服务商,可以快速交付高品质的测序数据。