Charm-Pure ™ 唾液 gDNA 提纯试剂盒(离心柱法)
室温保存,Proteinase K 和 RNase A 保存在 4 ºC。
试剂盒组成及贮存
Charm-Pure ™ 唾液 DNA 提纯试剂盒可从 Charm-Protect 唾液收集和储存液中提纯 gDNA,其组成如下表所示。所有 的组分除了 Proteinase K 和 RNase A 需要保存在 4 ºC 之外,其余组分室温保存即可。可进行 50、250 或者 5 次 gDNA 的提纯。
产品介绍 :
Charm-Pure™ 唾液 gDNA 提纯试剂盒专为从 Charm-Protect 唾液收集和保存瓶的唾液保存液中分离提纯高质量的 唾液 gDNA 而设计,操作步骤简单迅速。Charm-Pure™ 提纯系统离心柱(Spin-Column)采用改进的硅膜来选择性地 吸附核酸,较常规的硅膜更加高效地提纯高纯度的唾液 gDNA。抽提缓冲液中的 DNA 分子可特异性地与改进后的 硅膜相结合,而蛋白和其它污染物不被结合而保留在溶液中透过硅膜。用 Washing buffer 来清洗离心柱(SpinColumn),去除未结合的物质,提纯的 gDNA 可用 Elution Buffer(EB2)或水来洗脱。提纯的 gDNA 直接可用于下 游反应如限制性酶切反应、SNP 分析、PCR、序列分析、全基因组扩增(WGA)和 DNA 甲基化分析等。
所需的额外材料
• 无水乙醇
• 异丙醇
• 1.5 ml 或 2.0 ml 离心管
• 唾液收集和保存瓶中的 Charm-Protect 唾液 DNA 保存液
• 移液器和吸头
• 可离 1.5 ml 或 2 ml 离心管的离心机
• 涡旋振荡器
• 水浴锅或恒温金属浴
常规防范
1. 该试剂盒仅用于实验。
2. 实验操作时穿实验服,戴一次性手套。避免摄取和吸入试剂,避免与试剂盒中试剂进行皮肤接触,一旦接触, 用手彻底冲洗。
3. 提纯核酸 DNA 时,使用无菌新吸头避免污染。
实验之前准备
1. CT-236-M 试剂盒,加 22 ml 无水乙醇到 Washing Buffer I(WB1)中,充分混匀。CT-236-L 试剂盒,加 110 ml 无水乙醇到 Washing Buffer I (WB1),充分混匀。CT-236-S 试剂盒,加 2.2 ml 无水乙醇到 Washing Buffer I (WB1),充分混匀。注意在瓶上做好标记表示已加乙醇!– 室温保存,加了乙醇的 WB1 在六个月之内使用。
2. CT-236-M 试剂盒,加 44 ml 无水乙醇到 Washing Buffer II(WB2)中,充分混匀。CT-236-L 试剂盒,加 220 ml 无水乙醇到 Washing Buffer II(WB2),充分混匀。CT-236-S 试剂盒,加 4.4 ml 无水乙醇到 Washing Buffer II (WB2),充分混匀。注意在瓶上做好标记表示已加乙醇!– 室温保存,加了乙醇的 WB2 在六个月之内使用。
3. 该试剂盒可从 100 µl - 1200 µl 唾液保存液中提纯 gDNA。
4. 在进行 gDNA 提纯实验之前,为了避免 gDNA 降解,请遵守标准的 Charm-Protect 唾液 DNA 保存液收集和保存 程序。
操作指南
制备裂解液
以下步骤适用于从 300 µl 唾液保存液中提纯 gDNA。若需从 600 µl 唾液保存液中提纯 gDNA,请来电咨询详细步 骤。
1. 加 10 µl RNase A(RA2)到一个 1.5 ml 或 2.0 ml 的离心管中。
2. 将储存在 Charm-Protect 唾液收集瓶中的唾液样品与唾液保存液来回颠倒和震荡 7 - 8 次后静置 3 - 5 分钟。
3. 从唾液收集瓶中吸取 300 µl 唾液保存混合液到加了 RNase A(RA2)的离心管中,吹打溶液 8 - 9 次或盖上盖子 后颠倒离心管 7 - 8 次,混合均匀(当吸取唾液混合液时,注意不要吸到收集瓶底颗粒状沉淀,如食物颗 粒。)。
4. 加 10 µl Proteinase K(PK2)到唾液混合液中,盖上离心管盖子,颠倒离心管 15 - 18 次,充分混匀。
5. 将离心管置于 62 ºC 水浴锅或金属浴中温育 45-60 分钟,期间颠倒混合离心管。如果愿意,也可置于 52 ºC 温育 过夜。
结合 DNA
1. 向上述唾液混合液中加 150 µl Binding Buffer(GB3)和 200 µl 异丙醇,来回吹打溶液 8 - 9 次,混合均匀。
2. 将所得的唾液混合液(约 670 µl)转移到含有收集管(Collection Tube)的离心柱(Spin-Column)中,室温下 8000 rpm(RCF = 5800 g)离心 1 分钟。
3. 取出 Spin-Column,将收集管中的滤液予以丢弃,将 Spin-Column 重新插入到收集管中。
清洗 DNA
1. 向 Spin-Column 中加 500 µl 含有乙醇的 Wash Buffer I(WB1)。
2. 将带有收集管的 Spin-Column 以最大转速(≥ 13000 rpm 或 16000 g)室温离心 1 分钟, 倒掉收集管中滤液。
3. 向 Spin-Column 中加 500 µl 含有乙醇的 Wash Buffer II(WB2)。
4. 将 Spin-Column 以最大转速(≥ 13000 rpm 或 16000 g)室温离心 1 分钟,倒掉收集管中滤液。
5. 重复步骤 3 和 4,即用 Wash Buffer II(WB2)洗两次。
6. 以最大转速将带有收集管的 Spin-Column 离心1 分钟来彻底去除含有乙醇的 Wash Buffer。丢掉收集管。将 SpinColumn 放入干净的 1.5 ml 离心管中。(在转移 Spin-Column 时,注意避免残留的 Wash buffer 接触到 SpinColumn 的尖端。)
gDNA 的洗脱
1. 取一定体积的 Elution Buffer(EB2)到 1.5 ml 离心管中,置于 72 °C 金属浴或水浴中加热。
2. 向 Spin-Column 的膜中央,加 50 µl 预热的 Elution Buffer(EB2),室温下至少静置 1 分钟。
3. 室温下最大速度离心 1 分钟,1.5 ml 离心管中的滤液即为纯化的 gDNA。注意:如果有需要,可用 50 µl Elution Buffer(EB2)进行再次洗脱。这一步可增加产量 15 - 30 %,但提纯的 gDNA 因为体积增大,终浓度会降低。
4. 洗脱到离心管中的 gDNA 可直接用于下游反应,或者置于 4 ºC 短期保存或 - 20 ºC 长期保存。
电泳及下游的应用
提纯的 gDNA 可用琼脂糖凝胶电泳进行质检。可用分光光度计或荧光标记法或其它定量方法来测量产量。建议取 5-8 µl 提纯的 DNA 进行电泳检测。纯化的 gDNA 可直接用于下游反应,如限制性酶切反应、引物延伸、SNP 分析、 PCR、STR 分析、DNA 序列分析、全基因组扩增(WGA)及其它分子实验操作。
常见问题及解决方案
DNA 产量低:起始材料质量差。 裂解不彻底。 样品本身量不同(统计发现,每个人的唾 液 DNA 含量是不同的,小孩 DNA 量少, 老年人 DNA 量多)
解决方案: 确保严格遵守手册推荐的样品收集和保存程序。 62 ºC 温育时间延长 15-30 分钟。 增加提纯时唾液使用量,用 600 µl - 1200 µl 唾液 保存液来提纯 gDNA,请来电咨询详细步骤。
PCR 没有产物 ,原因:PCR 反应液中漏加组分
解决方案:确保加了所有的组分。核对 PCR 反应的阳性对照 和阴性对照。