博奥晶典 人类长链非编码RNA 芯片 v4

  北京博奥晶典生物技术有限公司与中国科学院生物物理研究所陈润生院士课题组共同开发的博奥晶典人类长链非编码RNA（lncRNA）芯片，继成功推出v1、v2、v3 芯片服务后，又推出新一代的博奥晶典人类长链非编码RNA 芯片v4 服务，芯片上包含共计约 40,916 种 lncRNA 检测探针和 34,235 种 mRNA 检测探针。      博奥晶典人类长链非编码RNA 芯片目前已经完成食道癌、肺癌、肾细胞癌、肝癌、卵巢癌、甲状腺肿瘤、结肠癌、舌癌、胶质瘤、 乳腺癌、宫颈癌等十余种肿瘤的相关研究，检测总样品数超过4,500 个，为224 家单位提供了科研服务。助力21 家单位发表30 篇文章，影响因子总计超过114 分。2015 年博奥晶典人类长链非编码RNA 芯片 v4 获得了北京市新技术新产品（服务）证书。产品优势    涵盖各大主流非编码 RNA 数据库序列信息，完全覆盖 noncode.org 上所包含的所有非编码 RNA 数据以及最新发表文献报道的 lncRNA 序列信息，还包含陈润生院士课题组发现的共计 848 条(82 条已发表的脑 lncRNA 序列+766 条未公开发表的肝脏lncRNA 序列中长度的lncRNA 序列信息。产品参数数据结果展示差异lncRNA 靶mRNA 预测结果差异lncRNA-TF 预测结果应用案例lncRNA- 食管状细胞癌-biomarker 研究

• 研究背景

     lncRNA 功能失调与包括肿瘤在内的多种疾病的发生和发展有关，是近年来国际上生命科学研究的热点领域。中国医学科学院肿瘤研究所赫捷院士课题组与中科院生物物理所陈润生院士课题组合作利用 lncRNA 芯片系统检测了 179 对食管鳞状细胞癌 (OSCC) 和癌旁组织lncRNA 表达谱。表达谱数据分为训练集、测试集和独立验证集(n=60，59 和 60)，研究者采用 Random forest 法寻找生存相关的 lncRNAs，并用 Nearest shrunken centroid algorithm 构 建 lncRNA 表达签名。最终建立了一个包含 3 个 lncRNA 的表达签名，根据这 3 个 lncRNA 的表达特征可以有效区分高风险和低风险组，两组生存存在显著差异。 多变量 Cox 回归分析显示该 lncRNA 表达签名是食管鳞状细胞癌的独立诊断指标，通过分层分析显示这种区分在各个 临床分期的生存都存在显著差异。相关结果于2014 年2 月发表在国际著名期刊Gut 上（IF=14.66）。本研究中 lncRNA 表达谱芯片检测工作由北京博奥晶典生物技术有限公司完成。

• 研究思路                                                                                              

• 参考文献

Li J. et al., LncRNA profile study reveals a three-lncRNA signature associated with the survival of patients withoesophagealsquamous cell carcinoma. Gut. 2014 Nov;63(11):1700-10.lncRNA-ADINR 功能研究

• 研究背景

      c/EBPα 是脂肪形成过程中一个重要转录调控因子，但其本身是如何被调控的所知甚少，这里，来自中科院生物物理所陈润生院士课题组及中国医学科学院赵春华教授课题组的研究者们利用人lncRNA 芯片筛选到一条人lncRNA-ADINR，并通过功能研究发现ADINR 在脂肪分化中的作用。相关结果发表在2015 年11 月的Stem Cell Reports 上（IF=7.023）。本研究中 lncRNA 表达谱芯片检测及分析工作由北京博奥晶典生物技术有限公司完成。

• 研究思路

• 参考文献

Xiao T .et al., Long Noncoding RNA ADINR Regulates Adipogenesis by Transcriptionally Activating C/EBPα. Stem Cell Reports.2015 Nov10;5(5):856-65.lncRNA-mRNA-miRNA 平台联用

• 研究背景

     miRNA-mRNA-lncRNA 相互作用已经显示在癌症生物学中发挥关键的调节作用。来自南京医科大学公卫学院陈峰教授课题组的吴倩等老师，利用博奥晶典的lncRNA 芯片及miRNA 芯片系统地探索了雌***受体（ER）调控的RNA，然后使用差异表达的mRNA 和lncRNA 的共表达关系构建共表达网络。最后，将所选择miRNA-mRNA 网络添加到网络中，从而推断关键miRNA-mRNA-lncRNA 相互作用。本研鉴定到与ER 表达状态相关的RNA 可用于乳腺癌的临床治疗和预后。相关结果发表在2015 年12 月的J Cell Mol Med 上（IF=4.938）。本研究中人lncRNA 芯片及miRNA 芯片检测分析服务由北京博奥晶典生物有限公司完成。

• 研究思路

• 参考文献

Qian Wu.et al., Analysis of the miRNA–mRNA–lncRNA networks in ER+ and ER− breast cancer cell lines.Journal of Cellular &Molecular Medicine 19.12(2015):2874–2887.博奥晶典人类长链非编码RNA 芯片支持客户发表文章列表博奥晶典科研服务支持客户在lncRNA 研究领域发表的部分文章