小麦是重要的经济作物,其全基因组测序于2012年完成。Illunima公司根据小麦完整的基因组信息,率先设计并推出了基于其独特的微珠合成技术的小麦全基因组SNP检测芯片,小麦 90K SNP芯片。该芯片由Illumina公司与众多国际顶级的研究单位合作开发,位点信息覆盖度广,准确度高,基本涵盖了小麦分子育种中涉及的主要SNP信息。 小麦90KSNP芯片的位点包含了小麦典型物种的70,000个SNP位点及保守同源基因的5,000个SNP位点,T.durum物种的2,000~3,000 个 SNP 位点,Aegilops tauschii 物种的 5,000个SNP,1,000个第7组染色体的SNP位点等。产品优势数据结果展示应用案例全基因组连锁分析发现小麦黑胚病相关QTL
- 研究背景
小麦黑胚病是一种真菌病害。小麦感病后,胚部会产生黑点,降低麦粒品质,造成严重经济损失。本研究以小麦重组自交系(RIL)群体的273株小麦为材料,利用小麦90K SNP芯片,发现了9个与小麦黑胚病抗性相关数量性状位点(QTL)。
- 研究路线
- 参考文献
Liu J, He Z, Wu L, et al. Genome-wide linkage mapping of QTL for black point reaction in bread wheat (Triticum aestivum L.)[J].Theoretical and Applied Genetics, 2016, 129(11): 2179-2190.
- 博奥晶典支持发表相关文献
1. Wang J, Wen W, Hanif M, et al. TaELF3-1DL, a homolog of ELF3, is associated with heading date in bread wheat[J]. MolecularBreeding, 2016, 36(12): 161.2. Chen C, He Z, Lu J, et al. Molecular mapping of stripe rust resistance gene YrJ22 in Chinese wheat cultivar Jimai 22[J]. MolecularBreeding, 2016, 36(8): 118.3. Jin H, Wen W, Liu J, et al. Genome-Wide QTL Mapping for Wheat Processing Quality Parameters in a Gaocheng 8901/Zhoumai16Recombinant Inbred Line Population[J]. Frontiers in Plant Science, 2016, 7.4. Dong Y, Zhang Y, Xiao Y, et al. Cloning of TaSST genes associated with water soluble carbohydrate content in bread wheat stemsanddevelopment of a functional marker[J]. Theoretical and Applied Genetics, 2016, 129(5): 1061-1070.