货号: | NA102-01 |
规格: | 24rxn |
VAHTS AmpSeq Cancer HotSpot Panel
- one-tube:流程简单,从DNA到文库生成只需4小时,操作时间小于40分钟,中间无需纯化步骤
- 多类型样本兼容性:兼容基因组DNA、cfDNA、FFPE来源DNA
- 优秀的数据均一度:均一度≥95%
- 极低的模板起始量:模板低至10 ng基因组,极端情况可以尝试1 ng基因组
- 防止样本污染:末端引物消化技术使得文库不能再作为Panel扩增模板使用
- 消除引物冗余序列:引物序列几乎不被测序,更充分利用上机数据,节约成本
- 双平台兼容:能兼容主流的Illimina和Ion Torrent平台
one-tube建库解决方案
VAHTS AmpSeq 技术从基因组DNA 到生成文库都在一管内(one-tube) 进行, 流程简单,中间无需纯化,耗时短,参见以下流程简图, 原理图见下图。
极高的on-target比例
VAHTSTM AmpSeq 特有的扩增技术,能最大程度保证文库的特异性,右图是利用VAHTSTM AmpSeq Cancer HotSpot Panel(Vazyme #NA102) 建库.NGS 下机数据统计结果。从结果上看,相同样本的on-target 比例重复性好,一些极端样本(如FFPE、cfDNA) 的on-target 比例跟普通基因组DNA 的是一样的。
优异的均一度
VAHTSTM AmpSeq 技术在保证文库均一度上做了诸多努力,如右图所示利用VAHTSTM AmpSeq Cancer HotSpot Panel(Vazyme #NA102) 建库NGS 下机数据统计结果,分别统计了大于平均深度的0.2×、0.3×、0.5× 的扩增子比例,表现优秀。
卓越扩增子GC兼容性
多个不同GC 的扩增子在一个反应里同时扩增容易造成偏好性,VAHTS AmpSeq 技术克服了这样的困难,如下图所示利用VAHTS AmpSeq Cancer HotSpot Panel (Vazyme #NA102) 建库NGS 下机数据统计结果,分别统计了不同GC 含量的扩增子的深度值,GC 兼容性良好。
Vazyme 的科学家潜心钻研推出了 VAHTSTM AmpSeq 技术,实现了在一个 PCR 管(one-tube) 内完成多重 PCR、引物消化、接头连接,实现了从基因组DNA到靶向文库one-tube式的反应,中间无纯化步骤,从PCR到生成文库实验时间低至4小时,其中操作时间小于40 分钟。VAHTSTM AmpSeq 技术包含多个核心技术模块:多重引物设计技术模块、多重PCR 聚合反应技术模块、扩增子末端引物消化技术模块和专有的双平台接头技术模块。
VAHTSTM AmpSeq 技术能够兼容多种来源的模板,通过末端引物消化技术能够防止样本之间的污染并消除了冗余的引物序列,节约了数据量,并兼容主流的Ion Torrent&Illumina 平台,具有优秀的数据均一度。而one-tube 特点使得建库过程异乎寻常的简单,操作用时短。