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成像单个荧光标记的大分子可以揭示其他实验根本不能的活动细节。然而,在生理浓度下,背景荧光经常压倒来自单个分子的信号。
来自哈佛大学的科学家团队,包括沙特阿拉伯国王阿卜杜拉科技大学(KAUST)的Satoshi Habuchi,开发了一种新技术PhADE(光活化,扩散和激发),克服了背景荧光问题。
感兴趣的蛋白质用一种荧光蛋白标记,当被特定波长的光脉冲击中时,该荧光蛋白可以改变其发射特性。然后将蛋白质加入已固定在微流体流动池中的结合底物上。在表面附近的一部分荧光蛋白光活化后,快速扩散消除了任何可能引起背景荧光的未结合蛋白,仅留下与底物形成键的分子。然后可以在荧光激发下观察这些单独的分子相互作用。
研究人员使用PhADE来研究DNA复制的动力学。对Fen1的单个分子进行成像,这是一种参与将DNA片段连接在一起的酶,与固定的DNA相互作用,它们能够测量复制进行的速率,复制起始的频率和Fen1的半衰期。
作者强调PhADE的广泛潜在应用,因为它可以设想用于检测具有多种可能的荧光团的任何蛋白质。“我们希望PhADE将成为研究复杂生化反应动力学的一种广泛使用的方法,特别是在蛋白质 - 蛋白质或蛋白质 - 核酸相互作用较弱但无法用常规单分子工具成像的情况下,”约翰内斯沃尔特说,他是该研究的资深作者之一。
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