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自推出以来近四年，临床测序探索性研究(CSER)计划在确定基因组学在医学中的作用方面取得了重大进展。CSER研究人员发现了基因组变异 - DNA代码的差异 - 可能导致疾病; 改进了DNA测序结果的分析和解释; 并提供了在临床护理中使用基因组学的伦理，法律和社会影响的新见解。
CSER - 由国家人类基因组研究所(NHGRI)和国家癌症研究所资助，这两个部分都是国立卫生研究院 - 即将结束其第一轮研究奖。为了帮助确定潜在的后续计划的方向，CSER研究人员和同事最近在马里兰州贝塞斯达召开了为期一天的会议，将基因组测序纳入临床护理：CSER和Beyond。
会议重点关注该计划的目标和成就，并确定未来5到10年内可在临床测序计划中解决的未来挑战和机遇的优先顺序。例如，为了加强在临床中使用基因组测序的案例，发言者认为必须继续建立将遗传构成与疾病联系起来的证据，并更好地理解基因组测序使用与疾病结果之间的关系。其他人强调了改进标准以确定变体的作用以及它们在患者病情中的作用的重要性。会议参与者建议更多地研究基因组测试对患者和家属的影响，以及如何向他们提供这些信息。
“CSER检查患者的基因组信息对患者及其家人的真正意义。它还研究了患者与医疗从业人员和临床实验室的互动如何告知基因组信息应如何应用于临床护理，”Lucia Hindorff博士说。 .D。，NHGRI基因组医学部CSER项目主任。
虽然许多演讲展望未来，但一些CSER研究的潜在影响更为直接。在一项研究中，密歇根大学的研究人员发现了儿童癌症中DNA测序的益处。在另一个例子中，北卡罗来纳大学教堂山分校的研究人员使用DNA测序来帮助诊断和治疗患有肌张力障碍的女性，这是一种疼痛的肌肉疾病。波士顿Dana-Farber癌症研究所的科学家开发了一种计算机程序，根据癌症的重要性对患者的基因组突变和变异进行分类和排序，可能有助于指导治疗。
从证明DNA测序事项到处理意外结果
在一次会议期间，研究人员讨论了临床DNA测序对患者护理产生影响的证据的必要性。研究人员表示，在医生，患者和医疗保健系统支持使用DNA测序之前，临床医生需要证据表明，与其他方法相比，它可以改善护理并且具有成本效益和时间效益。
合伙医疗中心和波士顿布莱根妇女医院分子医学实验室主任Heidi Rehm博士表示，描述基因和变异临床相关性的综合资源才刚刚开始发展。她补充说，CSER有机会在患者护理中建立基因组学和基因组检测的“证据基础”。
目前，关于医生可以对引起疾病的变异或基因突变的信息做什么的建议有限。Rehm博士说，准确定义患者的疾病并了解DNA测序中发现的变异的作用是一项挑战。
“我们需要为基因组测试开发新的工具和标准。实验室应该协同工作，共享数据并标准化解释变体意味着什么以及它们如何导致疾病，”Rehm博士说。
几位发言者谈到了改进这种解释的必要性。他们说，研究人员往往留下一个令人不满意和不确定的结果，被称为“具有不确定意义的变种”。
西雅图华盛顿大学医学遗传学系主任Gail Jarvik医学博士说：“为了使基因组医学有效和安全，我们需要知道变种的作用。” “我们必须就解释它们的一致方式达成一致。”
一些与会者强调，需要在疾病基因组研究中充分代表不同人群。北卡罗来纳大学教堂山分校遗传学和医学博士杰森·埃文斯博士提到了许多理由，包括在基因组学研究中包括少数和医学服务不足的人群，包括减少健康差异和行为的必要性好科学。
“临床上，我们需要确保识别疾病相关变异的进展能够传播给所有人群，”他说。“我们还需要确保少数群体的参与，以使调查结果有用，因为变异构成的差异可能针对具有不同祖先背景的人群。”
CSER由九项研究资助和一项NHGRI校内研究计划组成。每一个都涉及招募患者的临床和技术问题，产生临床基因组测序数据以及从基因组测试中收集的信息的社会影响和心理影响。该联盟还包括九个小组，专注于了解向患者和家属返回基因组检测结果的伦理，法律和社会复杂性。基因组检测结果的返回并不是一个简单的过程，因为基因组检测总是会出现意外 - 以及所谓的偶然结果。
与会者得出结论认为，如何处理偶然发现的问题仍然是一个挑战。虽然CSER研究人员和其他人能够对基因组和整个外显子组(基因组的蛋白质编码部分)进行测序，但Rehm博士建议，最近可能会过多强调将“预测”信息返回给医生和患者“当我们的能力预测疾病的发展是如此有限。“
在总结会议中，与会者谈到了许多与基因组医学相关的主题，从监管机构的角色到公众的看法。
纳什维尔范德比尔特大学医学院个性化医学助理副校长Dan Roden表示，尽管使用基因组测序技术存在挑战，但“我们不应忽视该技术在医学方面的作用”。特别是对于难以诊断的疾病。
埃文斯博士说：“这些问题已经从”我们能否将临床基因组学整合到患者护理中“转变为”我们怎样才能做得更好，价值更高“。“CSER非常有能力认真思考这些挑战。我们现在开始寻找这些问题的答案。这是一个令人难以置信的激动人心的时刻。”
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