遗传研究人员对巨桉的基因组进行序列分析

2018-12-19来源: 阅读量:111
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一个庞大的国际科学家团队对巨桉(被称为淹水口香糖或玫瑰口香糖)的6.4亿碱基对基因组进行了测序和分析。

遗传研究人员对巨桉的基因组进行序列分析

树木在全球碳循环中发挥着重要作用。总的来说,它们代表了碳的主要陆地储存库,同时发挥活跃的二氧化碳捕获和处理以及被动储存作用。

考虑到这些优点,桉树可以从热带和温带地区采集,有700多种富含遗传变异的物种。

桉树中大约80%的木质生物质是由纤维素和半纤维素制成的,这两种糖都是长链糖,其余的生物质主要由木质素组成,木质素是坚韧的“胶水”,将它们全部固定在一起。

“桉树现在是世界上许多地方用于造纸和生物能源等应用的硬木种植园,”墨尔本大学的Antanas Spokevicius博士说,该论文的共同作者发表在“自然”杂志上。

“这一资源将为育种和生物技术树木改良计划提供巨大的推动力,并使我们与许多其他重要作物物种一样,其改良计划从序列测定的基因组中获益匪浅。”

“对桉树基因组进行测序的努力始于十多年前。已经有一些国际研讨会,会议和其他交流活动将国际桉树研究界聚集在一起,讨论并现在创造资源,以释放桉树作为真正的全球燃料和纤维来源的潜力,“Spokevicius博士说。

“遗传密码将帮助我们了解澳大利亚生态系统的基础物种以及它如何影响其他物种,从真菌到考拉,”共同作者,澳大利亚国立大学的Carsten Kulheim博士说。

“这将为科学家们提供工具,让他们了解考拉将采食哪种植物而不是以此为食,这有助于采取措施保护考拉栖息地。”

所述的序列巨桉基因组由DNA 640万个碱基对,包含超过36000个基因-几乎两倍于人类基因组的基因数。

科学家们确定了编码18个最终酶促步骤的基因,用于生产纤维素和半纤维素木聚糖,这两种细胞壁碳水化合物均可用于生物燃料生产。

他们的结果揭示了一个古老的全基因组重复事件,估计大约在1.1亿年前发生过,以及在串联重复阵列中异常高比例的基因。

研究人员的另一项发现是,在迄今为止的测序植物中,桉树显示出特殊代谢物如萜烯的基因多样性。

他们确定了113个负责合成萜烯的基因。这些碳氢化合物可用作防治害虫的化学自我防御,同时提供用于医药咳嗽滴剂和工业过程的熟悉的芳香精油。

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