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在处理例如遗传性疾病或癌症时,检查患者的基因组似乎是合乎逻辑的。本月的Genome Advance采用基因组学方法研究世界上最主要的死亡原因之一,在这种情况下,我们通常不会将其与基因组学相关联 - 创伤。创伤性损伤 - 车祸,摔伤,打击等 - 是44岁以下美国人死亡的主要原因。严重受伤的患者经常死于多器官衰竭,通常是在感染和由此引起的炎症反应后。
发表在“ 公共科学图书馆·医学 ”杂志上的一项研究是由炎症和主持人对伤害大规模协作研究项目的反应进行的,并参与了一项前瞻性临床试验,该试验是在波士顿麻省总医院对168名重症钝性创伤患者进行的。和领先的创伤中心在美国。该研究在受伤后28天内为每位患者创建了“患者内”基因表达谱。定期采集血液样本,并对这些样本进行测定,以确定哪些基因和途径随时间推移或开启。
使用马歇尔多器官功能障碍评分(用于重症监护医学来描述复杂的临床结果),研究人员将患者分为五个亚组,从快速康复的患者到死于多器官衰竭的患者。根据结果对患者进行分组,然后研究人员寻找基因表达的常见模式,这些模式可能与这些患者在ICU中的表现有关。
几种基因途径在不同组之间确实显示出随时间的不同调节模式。这些基因途径涉及控制免疫功能,以及对感染产生炎症反应。多器官衰竭通常在患者感染后感染,然后导致败血症,其中局部感染变为全身性。其中一种基因途径是Toll样受体(TLR)信号通路,是今年诺贝尔医学奖的主题。
特别是,在分析之后,两个基因途径脱颖而出。显示早期激活称为MHC-II(主要组织相容性复合体II类)的重要免疫途径的患者具有最佳临床结果。相反,在具有最差临床结果的患者亚组中,该基因途径迅速关闭。
同样,那些快速恢复的患者早期抑制了另一种称为p38 MAPK的途径,该途径在具有最差临床结果的亚组中被激活。这两种途径,以及其他显示其活性水平显着变化的途径,表明亚组之间的差异在伤后40至80小时之间最大,表明可能将它们用作重症监护医学中的生物标志物。识别有风险的人。甚至可能证明在患者遭受多器官系统衰竭之前用药物治疗这些炎症途径是可能的。
虽然我们距离临床使用这种技术还有几年的时间,但这项研究是首次证明采取全基因组方法(而不仅仅是单个基因)可能会带来红利的研究之一,即使在医学领域也是如此。这种方法似乎并不明显。
该研究称为通过患者内基因表达变化在严重受伤患者中解剖炎症并发症:纵向临床基因组学研究。Desai KH,Tan CS,Leek JT,Maier RV,Tompkins RG,Storey JD; 和炎症和主机对伤害大规模协作研究计划的反应。 PLoS Medicine,Sep; 8(9):e1001093。2011. [ PubMed ],由国家综合医学研究所资助,是美国国立卫生研究院的27个研究所和中心之一。
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