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小鼠模型广泛用于药物和医学研究，并且已知其肠道中的微生物群落可对研究输出产生显着影响。然而，关于栖息在小鼠肠道中的许多细菌，仍然没有足够的信息。有史以来第一次，一系列培养的细菌菌株提供了有关小鼠肠道微生物群的全面信息：慕尼黑工业大学的科学家能够分离，鉴定和归档一百种菌株，包括15种迄今未知的分类群。
它们在显微镜下很小并且在人类和动物身上都存在。它们可以帮助您从疾病中恢复或者让您生病：数十亿微生物，其中大部分存在于肠道，以及皮肤和身体其他部位，与宿主共生。这些微小的生物是至关重要的，专家将它们称为肠道微生物群或微生物群。慕尼黑技术大学(TUM)中央营养与食品研究所(ZIEL)的科学家们正在研究其特征，并对其进行更好的理解。
鉴定并存档来自小鼠微生物组的76种培养的细菌物种
获得有关肠道细菌与宿主之间相互作用信息的一个关键是小鼠模型。然而，到目前为止，只有少数小鼠肠道细菌可以公开获得并完全表征。这是研究的一个高度限制因素，因为它使通过分子技术获得的数据的注释复杂化，并且因为已经显示肠道微生物组在某种程度上特定于其宿主，并且研究人员已经在小鼠中使用其他来源的菌株。楷模。哈比尔博士。来自ZIEL的Thomas Clavel及其同事描述了“ 自然微生物学 ” 的新资源，这是第一次含有一百种培养的细菌菌株来自小鼠肠道微生物组。在这项研究中，检查了1500种培养物，鉴定了76种不同的物种并进行了存档。
“我们的工作目标是朝着解码小鼠肠道细菌群落的培养部分迈出一大步。还有很多工作要做。我们将把我们的工作提供给世界各地的科学家，并希望其他人克拉维尔说，他还将在慕尼黑工业大学研究肠道微生物组中的各种细菌十年，这也有助于找到完成这个难题的部分。尽管小鼠肠道微生物组与人类微生物组具有许多相似之处，但该研究表明，该系列中约20%的菌株更喜欢定殖小鼠的肠道。
为了更好地了解肠道中的定植过程，首先需要对细菌进行鉴定和详细表征。“因为小鼠模型对于临床前研究是不可或缺的，现在提供的资源将有助于更好地理解微生物 - 宿主相互作用和更高程度的标准化”，Clavel说。
具有特定功能的新细菌
研究人员第一次能够表征具有重要功能特性的新细菌：例如，丁酸纤维素(Flintibacter butyricum)从糖和蛋白质中产生短链脂肪酸丁酸盐 - 这是肠道细菌领域的罕见特性。丁酸盐是肠道发酵的主要产物，并且已被证明在许多研究中具有抗代谢疾病的抗炎和积极作用。
“我们对肠道微生物组的知识仍然存在很大差距，但公开提供的培养小鼠肠道细菌及其遗传物质的数据库，我们现在更接近我们的目标”，TUM的Thomas Clavel热情地说。
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