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新加坡的研究人员开发了一种新的高通量方法，可以确定核糖核酸(RNA)分子如何以无偏见和大规模的方式聚集在细胞内。这种新开发的技术命名为SPLASH，或补骨脂连接和选择杂交体的测序，用于描述人类和酵母细胞中的RNA网络，其动力学以及结构组织如何影响细胞中的翻译和衰变过程。
该项目由A * STAR新加坡基因组研究所(GIS)的万悦和Niranjan Nagarajan共同领导，并于2016年5月12日在线发表于Molecular Cell。
RNA是在调节细胞中基因表达中起重要作用的关键分子。虽然科学界已经广泛研究了过去几十年中蛋白质和染色质等微型细胞机器如何相互折叠和相互作用，但人们对RNA如何与自身或与其他RNA分子相互作用知之甚少。这种限制促使团队提出SPLASH以促进对RNA相互作用的理解。
该研究的共同主要作者和GIS干细胞与再生生物学初级首席研究员Wan博士说：“细胞是一台复杂的机器;我们需要了解其所有组件的配置，以便能够设计和/或RNA形状和RNA 相互作用网络是细胞功能的关键。根据细胞需求，这些动态相互作用网络可以进行改造。最重要的是，靶向这些网络可能是抑制传染性生物的一种手段。Wan博士于2014年获得了着名的Branco Weiss奖学金，并因其抗菌药物耐药性而于2015年获得青年科学家奖。
该方法将使研究小组能够研究传染性生物的转录组 - 包括致病细菌，登革热和寨卡病毒 - 以了解这些基因组中RNA形态和网络如何通过病原体感染人类细胞。希望这些理解微生物致病性的努力将有助于新的抗微生物剂，抗病毒剂或针对这些病原体的疫苗。
“能够首次全面了解RNA相互作用组并捕捉其动力学，这是令人兴奋的。我们现在拥有了解RNA结构组织如何影响疾病和病原体生物学的工具，最终的目标是利用这种理解新药和这篇论文的共同主要作者，GIS计算与系统生物学首席研究员Nagarajan博士补充说，“抗菌药物”。
地理信息系统执行主任Ng Huck Hui教授说：“理解RNA相互作用网络和基因调控是科学界关注的一个领域。在SPLASH发展之前，很少有工具可以让研究人员深入研究这一研究领域。现在，我们开始了解不同生物体内RNA相互作用网络的动态。我希望它能帮助社区更好地了解RNA在体内如何发挥作用，从而从他们新获得的见解中获益。“
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