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瑞典卡罗林斯卡医学院的科学家开发出一种新技术，使他们能够从组织中分离出单个神经元并分析其中的基因表达。这项研究发表在Nature Communications上，展示了神经科医生如何利用这种方法来区分可能表现出与疾病不同的密切相关的神经元。该方法还可以对其他领域有价值，例如癌症研究，病理学和生物标志物鉴定。
“类似的分析过去需要数百个，甚至数千个细胞，”神经科学系的Eva Hedlund说道，他与卡罗林斯卡医学院细胞与分子生物学系的Qiaolin Deng一起领导了这项研究。“我们的方法学发展使我们能够有效地分析来自人类和小鼠组织的少量细胞，甚至是单个神经元。”
识别不同细胞群中基因表达的能力是研究人员理解疾病机制和生物过程的有效工具。他们通常面临的两个障碍是缺乏组织材料，尤其是患有不同疾病的患者和细胞群。在许多情况下，没有可用于鉴定细胞的独特遗传标记。因此，需要能够识别和分析稀缺组织中少量细胞的方法。
KI的团队现在已经结合了两种现有方法来开发一种他们称之为LCM-seq的新方法。首先，他们使用激光捕获显微镜(LCM)从组织样本中剖析特定细胞，然后进行深度RNA测序，以研究其中的所有活性基因。
“这项技术的一大优势是组织不需要被打破，”乔林博士说。“由于这一点，位置信息在每个分离的细胞中保持完整。鉴于我们不必从细胞中纯化RNA分子并且可以使用现成的试剂，LCM-seq更简单，更便宜并且更高重复性和灵敏度比以前的方法。“
研究人员还表明，LCM-seq可用于更多地了解非常相似的神经细胞群。他们研究了从脊髓的不同部位分离的运动神经元，这些神经元在不治愈的疾病ALS中易于变性，并且检查了来自帕金森病中被破坏的中脑的不同部分的多巴胺细胞。
“我们证明，我们可以发现帕金森病易于萎缩的多巴胺细胞与耐药的多巴胺细胞之间的具体差异，”Hedlund博士说。“由于LCM-seq需要的细胞非常少，因此该技术可用于其他领域，如癌症生物学，病理学和生物标志物鉴定。”
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