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来自VIB和UGent的比利时科学家开发了Virotrap，一种用于在天然条件下纯化蛋白质复合物的病毒颗粒分选方法。该方法将诱饵蛋白与其相关的蛋白质配偶体一起捕获到从人类细胞中出芽的病毒样颗粒中。像这样，不需要细胞裂解，并且在纯化过程中保留蛋白质复合物。本周在Nature Communications上发表的一篇论文中描述了这种开创性技术的开发和应用。
VIB / UGent教授Sven Eyckerman非常了解蛋白质组学实验室和相互作用组学实验室，他非常清楚常规方法分析蛋白质复合物的缺点。基于质谱的破坏开放细胞膜的策略所需的裂解条件通常会影响蛋白质 - 蛋白质相互作用。“对蛋白质复合物进行经典研究的第一步，基本上将高度组织化的细胞结构变成了一个混乱的大汤”，Eyckerman解释说。
受病毒生物学的启发，Eyckerman提出了一个创造性的解决方案。“我们利用HIV颗粒形成的自然过程，通过攻击一种完全安全的病毒来从细胞中诱出完整的蛋白质机器，从而使我们受益。” 众所周知，HIV病毒在其形成颗粒期间捕获许多宿主蛋白质。通过将诱饵蛋白与HIV-1 GAG蛋白融合，相互作用配偶被困在从哺乳动物细胞中萌芽的病毒样颗粒中。接下来使用标准蛋白质组学方法来揭示这些颗粒的含量。合适的是，该团队将方法命名为“Virotrap”。
Virotrap方法非常特殊，因为蛋白质网络可以在自然条件下进行表征。通过将蛋白质复合物捕获在病毒样外壳的保护环境中，在纯化过程中保留完整的复合物。研究人员表明，该方法适用于检测已知的二元相互作用以及基于质谱的新型蛋白质配偶体鉴定。
Virotrap是一个教科书的例子，它将研究团队与专业知识结合在一起。与Jan Tavernier(VIB / UGent)和Kris Gevaert(VIB / UGent)实验室的交叉授粉促成了该平台的开发。
Jan Tavernier：“Virotrap代表了共复杂分析中的一个新概念，其中复杂的稳定性在物理上受到保护性物理结构的保证。它与现有的相互作用组学方法的库存互补，但也具有其他领域的潜力，如药物靶标表征我们还开发了一种小分子变体的Virotrap，它可以成功地捕获小分子诱饵的蛋白质配偶体。“
Kris Gevaert：“Virotrap也会影响我们对疾病通路的理解。我们实际上惊讶地发现这种基于病毒的系统可用于研究抗病毒途径，如Toll样受体信号传导。了解这些蛋白质机器在其自然环境中是如果我们想要调节他们在病理学上的活动，这是必不可少的。“
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