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马里兰大学医学院(UM SOM)的一个多学科研究小组首次确定了各种大肠杆菌菌株的基因组成，每年大肠杆菌都会杀死数十万人。该论文发表在最近一期的“ 自然微生物学 ” 杂志上，分析了肠致病性大肠杆菌(EPEC)的DNA ，这是引起腹泻的细菌菌株。
由UM SOM基因组科学研究所(IGS)微生物学和免疫学副教授David Rasko博士和UM SOM医学教授Michael Donnenberg领导的科学家发现，某些菌株通常更致命相对于其它的。结果将有助于研究人员集中精力识别，治疗和潜在控制这些更危险的版本。这可以更好地了解细菌究竟是如何造成损害的，最终可以更有效的治疗方法，可以显着降低腹泻病的死亡率，腹泻病是全世界儿童死亡的主要原因。每年腹泻导致大约760,000名五岁以下儿童死亡。它也是五岁以下儿童营养不良的主要原因。在全球范围内，有近1个。
“这些研究结果确实有助于我们以一种新的方式绘制细菌与这些疾病之间的联系。几年前这种研究是不可能的，”拉斯科博士说。“但随着新进展，我们可以做出这些令人兴奋的发现。” 拉斯科将这项研究描述为“基因组流行病学”，这是一种新的公共卫生科学方法，它将最先进的技术与对致病菌的广泛了解相结合，这两种技术都存在于马里兰大学医学院。
Rasko博士及其同事，包括冈比亚，马里，肯尼亚，莫桑比克，印度，巴基斯坦和孟加拉国的研究人员，检查了70株大肠杆菌的基因组，这些菌株来自全球肠道多中心登记的感染儿童。研究(GEMS)。有些病例与死亡有关，有些病例有症状但没有死亡，有些则与症状无关; 因此，科学家们可以获得具有一系列结果的菌株。
他们分析了菌株之间的遗传差异，并将其定位于疾病结果。然后，他们根据遗传内容和临床结果将菌株分为几类。拉斯科说，他们不确定遗传变异如何与症状和结果相关联，但这种模式为进一步研究提供了丰富的领域。他怀疑增加的大肠杆菌致死率是由一组基因相互作用而不是一个或两个基因引起的。
“这项研究集中体现了IGS的全部意义，”IGS主任Claire M. Fraser博士说道。“我们希望采用基因组学方法，以新颖的方式使用它，这些方法可以为世界各地的临床医生提供实用的方法。”
在过去的几年中，IGS在传染病遗传学研究中的作用越来越大。2014年，它获得了国家过敏和传染病研究所提供的5年1520万美元的资助，用于开发基因组传染病中心。
“Rasko博士及其同事的这项工作是科学家如何使用数据和基因组学来解决困难的公共卫生问题的最前沿，”UM SOM Dean E. Albert Reece博士，医学博士，MBA，同时也是马里兰大学医学事务副主席，UM SOM的John Z.和Akiko Bowers杰出教授。“我相信他们将继续在我们的斗争中找出关键的线索，以改善世界各地患有疾病的人们的生活。”
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