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每年夏天在德国南部，奥地利和瑞士，大量的褐鳟鱼都会灭亡。来自慕尼黑工业大学(TUM)的一个跨学科团队现在发现了神秘的垂死鳟鱼的罪魁祸首。它是由一种以前未知的病毒引发的，该病毒与感染北大西洋和太平洋鲑鱼的病毒有关。
设置始终位于相同的河段。受害者总是褐鳟鱼。在几天内，他们的皮肤变黑，动物就会死亡。几十年来，研究人员和当局一直在寻找造成这种神秘大规模死亡的原因 - 迄今为止没有成功。
利用尖端分析方法，来自慕尼黑工业大学的RalphKühn教授和研究小组现已确定了引发褐鳟增生性变黑综合症(PDS)的病原体。
从河流到实验室
“最大的挑战是找出一个没人知道的病原体。一开始，它甚至不清楚是细菌，病毒，寄生虫还是环境毒素，”生物学家回忆道。
随后进行了十年的科学侦探工作。研究人员建立了两个实验站的Iller河畔河流之一的源头，奥伯斯多夫，其中近鱼从未被观察到的疾病; 在肯普滕附近的低层中的第二个，每年夏天都会有棕色鳟鱼死亡。
在两个站点，研究人员建立了用河水喂养的水族馆。从5月到9月，他们观察了水族箱中的鱼，并取出了冷冻的组织样本，并送到TUM实验室进行分析。
寻找下一代技术的线索
观察结果表明，PDS分三个阶段进展。最初，鱼看起来很健康。然后出现肝脏和肾脏等内脏器官的变化。在第三阶段，褐鳟皮肤变黑，此后不久动物死亡。“这种疾病的进展很快导致我们怀疑PDS是一种病毒性疾病，”Kühn说。
为了检测样本中的病毒，研究人员部署了一套现代分子遗传程序，称为下一代技术。可以使用这些程序严格分析基因组。
首先，在基因反应水平上表征鱼中疾病的进展。随后，研究人员研究了具有相似免疫反应的动物，以确定鱼的所有遗传物质的核苷酸序列及其可能的病原体。
在遗传干草堆的针
研究人员部署了计算机程序，以确定这一基因数据中的致病病毒。利用深层生物信息学处理，他们成功地鉴定了病原体遗传谱的部分，并将其与已知病毒的谱进行了比较。
扩展的病毒特异性测序导致病毒基因组的确定。结果：褐鳟鱼死亡背后的罪魁祸首是鱼类呼肠孤病毒。它与感染北大西洋和太平洋鲑鱼的病毒有关，在那里它会造成严重的经济损失。
在下一步中，研究人员希望在实验室中培育病毒并调查为什么它只发生在阿尔卑斯河的某些部分以及全球鱼类贸易在多大程度上促进其传播。
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