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莱斯特大学科学家开发的创新计算机软件正在揭示导致脑膜炎和胃肠炎的致命病原体的基因组成。该软件名为PhasomeIt，可快速扫描大量基因组并识别其相变基因，同时还将所有这些基因相互比较。这有助于我们理解一系列致命疾病的遗传过程。
来自莱斯特大学的研究人员，由遗传学和基因组生物学系的Chris Bayliss博士领导，将该软件应用于两个细菌家族的大量基因组序列 - 脑膜炎奈瑟球菌(脑膜炎的重要原因)和弯曲杆菌空肠炎(食源性胃肠炎的最常见原因)。这些研究发表在PLOS One和Microbial Genomics期刊上。
Bayliss博士解释说：“我们和其他人预测，对这些大型基因组的深入分析将揭示这些病原体如何适应其人类和家禽宿主的生命以及遗传变化如何导致有害感染。”
现代DNA测序技术现在产生了大量的基因组 - 生物体的整个遗传内容 - 许多不同生物的信息 - 从人类到微生物。
在许多情况下，甚至有太多数据无法用当前可用的计算机软件进行有效分析。
“这两种细菌用于适应环境和宿主压力的一种机制是可逆地切换开启或关闭编码负责与宿主相互作用的分子的基因，”博士的Joe Wanford解释道。学生在莱斯特大学遗传学和基因组生物学系从事研究工作。
“在许多情况下，该过程是有利的，因为ON状态基因允许与宿主细胞表面(例如在喉咙中)的紧密相互作用，而OFF状态允许逃避宿主抗体，这可能最终导致细菌死亡。由于其DNA的特异性鉴定特征，这些所谓的相变基因中的一些可以很容易地鉴定，但直到现在还没有办法快速分析这些基因在多个基因组中的存在和分布。
研究小组的分析表明，相变基因主要分布在致病(引起疾病)和共生(存在于体内，不会造成损害)的细菌种类之间，但这些基因的存在或表达存在轻微差异。可能在从无症状的我们的身体殖民化到完全疾病的过渡中发挥作用。
目前正在他们的实验室进行工作，以表征这些基因在疾病过程中的特定作用。
Bayliss博士补充说：“我们相信我们的新软件对于分析不断增加的基因组序列数量至关重要，并将继续为我们的细菌共生体的生命周期提供关键见解。”
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