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七鳃鳗是一种类似鳗鱼的原始脊椎动物,是一种用于神经生物学研究的流行生物,因为它具有相对简单的神经系统。研究脊髓损伤(SCI)的人特别感兴趣,因为与人类不同,七鳃鳗可以在脊髓损伤后约8周内再生神经连接并恢复正常活动。随着最近完成的七鳃鳗物种(Petromyzon marinus)的第一个参考基因组,这种鱼现在准备加速研究神经系统如何正常运作并在受伤后恢复。
在一项新的研究中,由David Schulz博士和Andrew McClellan博士领导的MU神经生物学家团队通过在基因组中注释47个离子通道的序列进一步推进了这一进步。研究人员使用生物信息学工具从可能属于离子通道家族的七鳃鳗基因组中鉴定序列,然后在神经系统组织中进行系统发育和基因表达分析以确认鉴定。结果发表在Marine Genomics期刊上。
“操纵神经系统分子方面的第一步是对构成神经系统的结构有一个基本的了解。通过识别七鳃鳗用于构建其离子通道的序列,我们打开了直接针对这些序列的大门测量他们在细胞类型中的表达水平,改变他们的丰度,看看神经系统如何反应,并检查他们在从脊髓损伤恢复中的作用,“负责研究的MU研究生Adam Northcutt说,他是该文章的第一作者。离子通道是细胞膜中的特殊孔,其将带电原子(称为离子)移入和移出细胞。在神经细胞中,离子通道基本上有助于电信号的传输和处理。鉴于离子通道在神经系统功能中的关键作用,作者表示,知道它们的序列将允许对神经系统进行更深入的研究。
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