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口腔癌因其在发展中国家的高死亡率而闻名,但国际科学家团队希望其最新发现将改变这一点。来自新西兰奥塔哥大学和加尔各答印度统计研究所(ISI)的研究人员发现,与患者相邻的健康组织相比,口腔癌组织中的表观遗传标记明显不同。
共同作者,奥塔哥病理学系的Aniruddha Chatterjee博士说,发现这些生物标志物与患者的生存密切相关。表观遗传学(对基因表达的非遗传影响)是一种强有力的机制,能够改变癌细胞中的基因表达而不改变DNA序列,并且可以导致肿瘤进展。
“这种现象相对较新,正在研究中,特别是口腔癌。这项研究是首批使用尖端方法鉴别口腔癌中表观遗传标记的研究之一,”他说。
该研究发表在Epigenomics期刊上,该团队在印度招募了16名口腔癌患者,他们既可以吸烟也可以是嚼烟或混合习惯,并从他们身上采集肿瘤和正常邻近组织的样本。
在分离样品中的DNA后,研究人员发现肿瘤细胞中的表观遗传谱与正常细胞相比有所改变。他们研究了一种表观遗传机制,即DNA甲基化,它指的是向DNA添加甲基,如书签。如何安排这些书签可以决定基因的表达和异常细胞的传播。
“通过在更大的癌症队列中进行验证,我们发现这些生物标志物的一部分与患者预后不良显着相关,”Chatterjee博士说。这些发现可以通过早期识别癌细胞来帮助挽救数千人的生命。
第一作者,ISI的Roshni Roy博士说,根据2019年印度抗癌研究报告,在全球发现的30万例烟草相关口腔癌病例中,86%来自印度。晚期诊断和预后不良是发展中国家这种癌症高死亡率的关键问题。
她补充说,与来自相同患者的相邻健康组织相比,该组惊讶地发现口腔癌组织中存在这种明显差异。“我们也惊讶地看到,小分子,称为microRNA,在吸烟者或咀嚼物或混合习惯的肿瘤中甲基化或去甲基化,表明根据烟草滥用的方式,治疗干预可能与患者不同,”她说。该研究强调了ISI和Otago之间合作的力量。
在Otago项目简化和开发分析大规模DNA甲基化数据的方法和工具之后,ISI的Bidyut Roy教授找到了Chattajee博士和Otago病理学系的Mike Eccles教授,以利用Otago在该领域的独特专长。
“这个项目非常有趣,这是在印度与这个团队合作并最终产生有用结果的绝佳机会。我在印度出生和成长,但新西兰现在回家了,所以对我而言,个人也很满意与Chat博士及其团队一起在印度与真实的患者样本合作并解决这个重要问题,“Chatterjee博士说。
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