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肿瘤流入血液的DNA开始被用于早期发现癌症和监测治疗效果。这种被称为循环肿瘤DNA(ctDNA)的DNA在另一项重要任务方面并没有那么有用 - 选择最好的抗癌治疗方法。事实上，使用ctDNA指导实体癌症的治疗决策一直存在争议。
赫尔辛基大学的科学家们建议，ctDNA可以指导治疗决策的乐观情绪可能是合理的。由系统生物学教授Sampsa Hautaniemi博士领导的这些科学家报告说，他们能够利用卵巢肿瘤排出的ctDNA来识别临床上可行的突变。
Hautaniemi的研究小组已经实施了临床循环肿瘤DNA工作流程，以检测500多种癌症相关基因的临床可行改变。此外，该组在治疗前，治疗期间和治疗后分析了来自12名卵巢癌患者的78个循环肿瘤DNA样本。研究人员收集的数据使用开放获取的ctDNA定制生物信息学分析管道和内部转化肿瘤学知识库进行分析，以检测临床上可操作的基因组改变。
这项工作的结果发表在5月3日的JCO精密肿瘤学，在一篇题为“前瞻性纵向ctDNA工作流揭示卵巢癌中临床可行的改变”的文章中。
“我们的结果显示ctDNA和肿瘤样本中突变和拷贝数改变的良好一致性，并且在7名患者(58%)中检测到与临床可用药物相关的改变，”该文章的作者指出。“在检测ERBB2扩增的基础上改变了一名化疗耐药患者的治疗，并且这种ctDNA指导的决定之后是显着的肿瘤缩小和癌抗原125肿瘤标志物的完全正常化。”
目前的研究主要集中在高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)，这是最常见和侵袭性的上皮性卵巢癌形式。诊断为HGSOC的患者中有一半以上在诊断后五年内死亡，即每年全球超过150,000名女性死亡。
HGSOC肿瘤由几个具有大量突变的异质细胞群组成。这种遗传变异性使得难以找到能够杀死所有癌细胞的药物，并且细胞在治疗期间不会对其产生抗药性。为了提高HGSOC治疗的疗效，目前的研究评估了作为精确医学模式的ctDNA是否可用于选择最佳治疗方案。
“分析ctDNA使我们能够检测基因组改变[不仅在早期癌症中，而且在晚期癌症中，[当]从肿瘤中进行活组织检查很困难甚至不可能时，”Hautaniemi说。“在目前的研究中，我们证明了循环肿瘤DNA可用于监测患者对治疗的反应，并找到药物组合来针对肿瘤基因组谱的跟腱跟踪。”
Hautaniemi的研究小组已经实施了临床循环肿瘤DNA工作流程，以检测500多种癌症相关基因的临床可行改变。在新发表的文章中，作者声称其概念验证研究表明ctDNA可以指导临床决策。此外，研究人员表示他们的研究结果表明，纵向ctDNA样本可用于识别化疗第一周期后反应差的患者。最后，研究人员坚持认为，他们提供了第一个全面的，开源的循环肿瘤DNA工作流程，用于检测实体癌症临床可行的改变。
“卵巢癌患者的预后仍然很差，”Hautaniemi指出。“然而，随着研究发现卵巢癌肿瘤中基因组改变的靶向疗法，未来看起来更加光明。我们目前处于卵巢癌精准医学的最前沿。我们的目标是了解卵巢癌如何抵抗目前的治疗方法，并利用这些知识找到更有效的精确治疗方法。“
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