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在土壤中，细菌和其他微生物因其分解有机物质，将碳释放到大气中的能力而众所周知。不太了解的是微生物如何在土壤中添加持久性碳化合物。科学家通过“微生物碳泵”的概念审查了这两个角色。该泵被认为是一种机制，用于整合微生物的对比分解和合成活动 - 如何与微生物残留物的“埋藏”相结合 - 影响土壤中的碳含量。
该评论提供了微生物在创造和维持健康土壤中的双重作用的新观点。土壤中微生物功能的详细信息对于改进计算模型至关重要。它们对于通报国家和全球关于土壤可持续性和脆弱性的讨论至关重要。土壤健康影响作物生长，生态系统服务和气候。
输入与有机物质分解之间的动态平衡调节了土壤中的碳循环。微生物被广泛研究作为分解的主要介质，特别是通过其细胞外酶的作用。研究较少的是微生物生长和死亡对土壤碳化合物产生的影响。由于土壤中微生物的活性生物量很小，微生物对土壤碳化合物形成的贡献一直未被充分认识。但是微生物的快速生命周期会随着时间的推移产生大量的有机残留物。尽管微生物残留物本质上易于分解，但最近的研究表明，通过与土壤矿物的亲密物理和化学联系，可以在土壤中稳定很大一部分。
研究人员回顾了微生物在土壤碳化合物循环中发挥的对比代谢作用(即分解代谢分解和合成代谢形成)。土壤“微生物碳泵”的概念借鉴了海洋文献，并结合“昆虫效应”(通过与土壤矿物相互作用稳定微生物残留物)，以创建一个框架，刺激和指导新的研究工作，目标是土壤中持久性碳化合物的微生物合成和周转。
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