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迄今为止,科学家们正在越来越多地研究微生物群落的结构及其与植物相关的成分,但很少有人在血管疾病的背景下这样做。
然而,这些研究可能通过开发生物接种剂和生物杀虫剂对保护作物产生重大影响 - 特别是对于葡萄等木本作物,这通常与较重的化学农药使用有关。
对于名为Xylella fastidiosa的细菌病原体尤其如此。当它在葡萄和其他木本作物的茎中繁殖时,它会损害植物内水分和养分的流动。这种被称为皮尔斯病的现象在加利福尼亚的葡萄酒,葡萄干和鲜食葡萄产业中是一个众所周知且经济上重要的问题。
皮尔斯病无法治愈,可在短短两年内杀死葡萄藤。寻找导致皮尔斯病的病原体X.fastidiosa的天然微生物威慑,可以对葡萄种植者和环境产生巨大的积极影响。
进入博士候选人。Elizabeth Deyett,Drs。M. Caroline Roper,Philippe E. Rolshausen以及加州大学河滨分校(UCR)的其他几位研究人员。他们研究了葡萄藤中的微生物群落及其与皮尔斯葡萄病的关系。
他们使用新一代测序和现代生物信息学工具来表征葡萄藤中的细菌和真菌微生物组。他们分析了皮尔斯病症状轻微的藤蔓样本,症状严重的样本,最后没有症状的样本。
结果表明,所研究的葡萄藤内的微生物群落主要由细菌和真菌组成 - 特别是变形菌和子囊菌 - 分别以假单胞菌和Pleosporales为主要细菌和真菌。
他们的数据还表明,细菌群落的聚集似乎是由荧光假单胞菌和X.fastidiosa的丰富细菌驱动的。
“有趣的是,我们发现当存在假单胞菌和无色杆菌时,Xylella fastidiosa的丰度较低,而皮尔斯病的症状则不那么严重,”罗尔斯豪森说。“这表明这些生物可能有助于葡萄藤的健康,并有可能成为有益的微生物,可以促进植物健康或直接与病原体竞争。”
“这项研究是高度跨学科的,涉及微生物学,微生物生态学,植物病理学和生物信息学。通过这项研究,我们现在才开始了解那里有哪些微生物,”罗尔斯豪森说。“这激励着我们,并希望其他人开始了解这些常驻微生物群的功能。”
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