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猝死综合症(SDS)是一种突出的大豆性土传病，可能具有破坏性。SDS产量损失可达100%，具体取决于受影响的大豆品种和出现症状时的发育阶段。
由于发生率的增加，SDS近年来已经进行了大量研究，土壤剖析是研究这种真菌病的主要工具。迄今为止，几乎所有土壤剖面都涉及在SDS存在的地方识别土壤的物理和化学特征。
在一篇新的Phytobiomes期刊文章中，题为“揭示影响大豆猝死综合症发展的微生物和土壤因子”，Srour，et al。向科学界展示一种分析土壤的新方法，以确定SDS的发生率和严重程度：不仅分析土壤的物理和化学特性，而且分析土壤的微生物。
“田间SDS的发生取决于物理和生物因素，土壤对疾病的抑制是一个众所周知的现象，”南伊利诺伊大学副教授，该文章的通讯作者Ahmad Fakhoury博士说。“促进和维持土壤对疾病的天然抑制作用可能是土壤病原体有效，可持续管理的必要条件。”
在这项研究中，研究人员分析了伊利诺伊州，爱荷华州和明尼苏达州45个大豆田的土壤样本。从田间的症状性斑块以及未发生SDS叶片症状的邻近区域收集样品。
然后在该研究中使用新的工具和技术来检测“患病”和“健康”土壤中的微生物群体，并将它们的存在与SDS的发生率和严重性相关联。
通过这些样本，Srour等人。研究了土壤微生物群落的作用，以及土壤样品的物理和化学性质与SDS发展的关系。他们测量了多种与土壤相关的因子，并使用特异于细菌，真菌，古细菌，卵菌和线虫的标记以及测序，以确定可能与SDS发育相关的关键类群。
通过这些方法，他们生成了14,200,000个序列，并将其映射到国家生物技术信息中心的核苷酸数据库，并使用几种生物信息学工具进行分类比较。
这种独特的分析方法发现，健康和病害区域之间的细菌和真菌群落结构存在显着差异，这表明土壤中多种微生物类群的相对丰度是SDS发生率的关键决定因素。
“本文介绍的工作记录了首次尝试使用宏基因工具评估生物因子在确定大豆猝死综合症(SDS)发病率方面的重要性，”Fakhoury说。“这基本上是解决影响这种疾病发生的生物相互作用的复杂性的第一次尝试。”
Fakhoury说他们的新方法和研究技术在其他几个方面很重要：
这些技术可用于指示土壤的“健康”及其维持Fusarium virguliforme的能力，Fusarium virguliforme是导致SDS的主要真菌病原体。
其他人可以在此研究的基础上进一步表征影响F. virguliforme的物种的作用并研究它们相互作用的生物学。
类似的技术可用于研究其他土壤病原体和疾病，以寻求其有效和可持续的管理。
“我们使用的新兴工具和技术可以区分复杂的微生物相互作用，”Fakhoury说。“这最终将使我们能够设计和采用更有效和可持续的战略来管理SDS和其他对农业生产有害的疾病。”
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